计算化学公社

标题: 请教各位老师一个问题,进行弱相互作用分析时什么时候不需要导入波函数文件? [打印本页]

作者
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xxx127    时间: 2025-4-3 16:31
标题: 请教各位老师一个问题,进行弱相互作用分析时什么时候不需要导入波函数文件?
sob老师这篇文章中使用Multiwfn做aNCI分析图形化考察动态过程中的蛋白-配体间的相互作用 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元用把配体以及与配体距离较近的残基原子保存为xyz轨迹文件便画出了相互作用的aNCI图。为什么有些文章使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元进行弱相互作用可视化的时候,需要导入波函数文件才能算?

作者
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18217265596    时间: 2025-4-3 16:59
省流:大体系算不动可以用一些仅基于3D坐标的方法
小体系用波函数 准
作者
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xxx127    时间: 2025-4-3 17:20
18217265596 发表于 2025-4-3 16:59
省流:大体系算不动可以用一些仅基于3D坐标的方法
小体系用波函数 准

感谢
作者
Author:
sobereva    时间: 2025-4-3 22:54
只需要坐标:mIGM、amIGM、IGM、promolecular NCI、aNCI、
需要波函数:IRI、IGMH、NCI

认真看完下面两篇综述,就全明白了
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表!
http://sobereva.com/667http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html

Tian Lu, Visualization Analysis of Covalent and Noncovalent Interactions in Real Space  预印版:ChemRxiv (2025) DOI: 10.26434/chemrxiv-2025-9t442




作者
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xxx127    时间: 2025-4-4 11:12
sobereva 发表于 2025-4-3 22:54
只需要坐标:mIGM、amIGM、IGM、promolecular NCI、aNCI、
需要波函数:IRI、IGMH、NCI

感谢老师的回复,我认真阅读一下!




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