计算化学公社

标题: 求助Gaussian软件模拟甲苯红外光谱一点也没有运行直接报错 [打印本页]

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shiyuyang    时间: 2025-4-5 14:01
标题: 求助Gaussian软件模拟甲苯红外光谱一点也没有运行直接报错
想请教大家我用Gussian软件对甲苯进行红外光谱计算用Opt+Freq,一点也没有运行直接报错,但报错文件也没有说明是什么错误,请问这是什么原因呢
[img]file:///C:\Users\DELL\AppData\Roaming\Tencent\Users\1793795525\TIM\WinTemp\RichOle\E0%X]79())_{YH[EJL8Q3O3.png[/img] (, 下载次数 Times of downloads: 20)

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shiyuyang    时间: 2025-4-5 14:03
win系统下
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wal    时间: 2025-4-5 14:54
看看是不是对应目录不存在/没有写入权限/磁盘满了

(自己加[Opt-Freq报错]这种标签会被社长揍的~)
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Stardust0831    时间: 2025-4-5 15:47
跑别的任务可以顺利跑出来么?如果别的任务也跑不通就检查安装问题。
如果只有这个任务跑不通,上传一下gjf文件,我帮你检查一下、也跑跑看。
最后顺带一提,高斯的windows版算是半个玩具,有很多限制。条件允许的话建议换linux版本高斯(windows系统可以开虚拟机用linux版高斯)
作者
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shiyuyang    时间: 2025-4-5 16:47
wal 发表于 2025-4-5 14:54
看看是不是对应目录不存在/没有写入权限/磁盘满了

(自己加[Opt-Freq报错]这种标签会被社长揍的~)

谢谢提醒,吓得我赶紧删了。谢谢回答,写入权限我是都开了的,而且d盘内存足够,位置也新建的文件夹,路径全是英文 (, 下载次数 Times of downloads: 18) (, 下载次数 Times of downloads: 19) ,gussian16W和gussview我又重新下载还是同样的错误。搞了两天这个问题都没解决555

作者
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shiyuyang    时间: 2025-4-5 16:54
Stardust0831 发表于 2025-4-5 15:47
跑别的任务可以顺利跑出来么?如果别的任务也跑不通就检查安装问题。
如果只有这个任务跑不通,上传一下gj ...

谢谢回答,我建的是一个甲苯,跑个优化也不可以,还是这种错误文件,也没有错误信息。安装三遍了还是这样的错误
(, 下载次数 Times of downloads: 19) (, 下载次数 Times of downloads: 18) 文件我传不上来就粘贴到这里吧,麻烦您帮我看看是我哪里有问题


%chk=D:\AYSY\MD\Gaussian\jiaben.chk
# opt freq b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity

jiaji

0 1
C                 -1.67628872   -2.11325944   -0.00276749
C                 -0.28112872   -2.11325944   -0.00276749
C                  0.41640928   -0.90550844   -0.00276749
C                 -0.28124472    0.30300056   -0.00396649
C                 -1.67606972    0.30292256   -0.00444549
C                 -2.37367072   -0.90528344   -0.00344949
H                 -2.22604772   -3.06557644   -0.00231749
H                  0.26837928   -3.06577244   -0.00145249
H                  1.51608928   -0.90542844   -0.00213349
H                 -2.22619172    1.25520356   -0.00539849
H                 -3.47327472   -0.90510044   -0.00362949
C                  0.48925935    1.63638852   -0.00404911
H                  0.68823221    1.93340644    1.00445977
H                  1.41367803    1.51410938   -0.52883282
H                 -0.09878219    2.38809427   -0.48783172

1 2 1.5 6 1.5 7 1.0
2 3 1.5 8 1.0
3 4 1.5 9 1.0
4 5 1.5 12 1.0
5 6 1.5 10 1.0
6 11 1.0
7
8
9
10
11
12 13 1.0 14 1.0 15 1.0
13
14
15


作者
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shiyuyang    时间: 2025-4-5 16:57
Stardust0831 发表于 2025-4-5 15:47
跑别的任务可以顺利跑出来么?如果别的任务也跑不通就检查安装问题。
如果只有这个任务跑不通,上传一下gj ...

我跑个优化也是同样的错误,文件里却没有对应的err提示。我建的是个甲苯模型,想试试红外分析,麻烦您帮我看看这个文件设置的有问题吗

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sobereva    时间: 2025-4-5 17:01
shiyuyang 发表于 2025-4-5 16:54
谢谢回答,我建的是一个甲苯,跑个优化也不可以,还是这种错误文件,也没有错误信息。安装三遍了还是这样 ...

确保fname那行后面提示的目录确实存在,否则Gaussian无法往里面产生临时文件

安装路径别搞得那么长,目录里出现两次Gaussian完全莫名其妙,纯粹给自己添麻烦。如下图所示,根本路径都不对应。强烈建议Gaussian、GaussView全都卸载了重装,全都装到D:\software\G16W下
(, 下载次数 Times of downloads: 20)

认真看置顶的社员必读贴了解怎么上传文件


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sobereva    时间: 2025-4-5 17:02
shiyuyang 发表于 2025-4-5 14:03
win系统下

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “Gussian软件甲苯模拟红外光谱” 改了,以后务必注意!下次将删帖+扣分处理。


并且好好拼Gaussian,不叫Gussian。乱拼程序名是很丢人的事,认真看
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298(http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html


作者
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Stardust0831    时间: 2025-4-5 22:24
shiyuyang 发表于 2025-4-5 16:54
谢谢回答,我建的是一个甲苯,跑个优化也不可以,还是这种错误文件,也没有错误信息。安装三遍了还是这样 ...

用g09的D.01版本帮你跑完了,文件放压缩包了。
删去了一些不必要的关键词,这么做的原因见《常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词

作者
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shiyuyang    时间: 2025-4-5 22:28
sobereva 发表于 2025-4-5 17:02
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

知道了记住了谢谢社长
作者
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shiyuyang    时间: 2025-4-5 22:35
sobereva 发表于 2025-4-5 17:01
确保fname那行后面提示的目录确实存在,否则Gaussian无法往里面产生临时文件

安装路径别搞得那么长, ...

谢谢社长回答,听了您的建议已重新安装。Gaussian和GaussView安装在D:\G16W下,不过还是同样的报错,文件中fname路径还是存在两个Gaussian,而且这个路径在D:\software下确实不存在。安装前已用geep卸载且相关文件夹已删除,安装过程中只有选择D:\G16W这个路径安装,请问社长这是什么原因呢 (, 下载次数 Times of downloads: 21)
作者
Author:
shiyuyang    时间: 2025-4-5 22:39
Stardust0831 发表于 2025-4-5 22:24
用g09的D.01版本帮你跑完了,文件放压缩包了。
删去了一些不必要的关键词,这么做的原因见《常见的多余 ...

非常感谢,我这边可以正常查看
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Stardust0831    时间: 2025-4-5 22:58
标题: cp2k-2025.1在Debian-wsl2中的安装(附所需所有第三方库)
shiyuyang 发表于 2025-4-5 22:35
谢谢社长回答,听了您的建议已重新安装。Gaussian和GaussView安装在D:\G16W下,不过还是同样的报错,文件 ...

windows版本的高斯本来相较于linux版本就有很多限制和操作不便之处,windows版本会明显差于linux版本。
建议直接配个虚拟机装linux版本高斯。
虚拟机的话我个人推荐直接用windows下linux子系统wsl,安装很方便,见:《如何使用 WSL 在 Windows 上安装 Linux
相较于wsl默认的Ubuntu,我个人更推荐使用Debian,Debian的换源可以参考我的这篇帖子
高斯的安装流程见:《Gaussian的安装方法及运行时的相关问题

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Author:
Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2025-4-5 23:41
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-4-5 23:54 编辑
shiyuyang 发表于 2025-4-5 22:35
谢谢社长回答,听了您的建议已重新安装。Gaussian和GaussView安装在D:\G16W下,不过还是同样的报错,文件 ...

可能Windows某个环境变量或者甚至注册表还残留有这个旧的路径,清一下看看。当然如果有使用许可、有设备条件,后续还有其他体系的其他计算任务的话,最好还是参考楼上所说找个专用的服务器装上Linux系统,跑更高效的Linux版的Gaussian。

编辑:想起来之前看到的http://bbs.keinsci.com/thread-50892-1-1.html一帖,确认一下,你要算的甲苯是气相的单个分子还是液体或晶体等凝聚相的?
作者
Author:
shiyuyang    时间: 2025-4-6 11:28
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-5 23:41
可能Windows某个环境变量或者甚至注册表还残留有这个旧的路径,清一下看看。当然如果有使用许可、有设备 ...

谢谢,确实是环境变量的问题,不报错了。
我的终极目标是根据红外光谱,核磁共振结果构建模型。
我的阶段目标是想对经典模型C192H166N4O19S9进行红外光谱模拟。
现在是刚接触到Gaussian软件,用个甲苯模拟看看结果的呈现。
也想请教下Gaussian可以实现对这种有机大分子模型红外光谱模拟吗
(, 下载次数 Times of downloads: 17)



作者
Author:
shiyuyang    时间: 2025-4-6 11:34
Stardust0831 发表于 2025-4-5 22:58
windows版本的高斯本来相较于linux版本就有很多限制和操作不便之处,windows版本会明显差于linux版本。
...

谢谢这么详细的教程。请问若使用虚拟机,我这台电脑配置可以吗
(, 下载次数 Times of downloads: 15) (, 下载次数 Times of downloads: 15)

作者
Author:
Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2025-4-6 12:13
shiyuyang 发表于 2025-4-6 11:28
谢谢,确实是环境变量的问题,不报错了。
我的终极目标是根据红外光谱,核磁共振结果构建模型。
我的阶 ...

好家伙,这几百原子的结构坐标是从哪来的……如此大分子叫做“经典模型”应该是你们研究煤的领域的说法吧,但论坛里的人并不都研究这样的体系,所以多解释一些为好。

在DFT的计算级别下做结构优化/振动分析/红外与核磁的计算,即使有高性能服务器也多半没法在有限时间内算得动这么大的柔性体系;17楼这个6核16 GB的电脑更不用想了,最多也就装虚拟机以后做点简单小分子的普通计算任务作为自己入门的练习,比如参加http://sobereva.com/355提到的培训班这样。这种硬件设备的问题也得和导师讲清楚哦,实验室肯定该出经费配计算机做此类研究的。

我感觉这种尺寸的有机物还是用经典分子力场研究的多,可能要考虑一下是不是真有DFT算红外/核磁的必要……
作者
Author:
Stardust0831    时间: 2025-4-6 13:39
shiyuyang 发表于 2025-4-6 11:28
谢谢,确实是环境变量的问题,不报错了。
我的终极目标是根据红外光谱,核磁共振结果构建模型。
我的阶 ...

以当前配置、 DFT级别基本上算不动。
可以尝试GFN2-xTB等半经验DFT。(xTB、orca等软件支持)
作者
Author:
shiyuyang    时间: 2025-4-6 15:00
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-4-6 12:13
好家伙,这几百原子的结构坐标是从哪来的……如此大分子叫做“经典模型”应该是你们研究煤的领域的说法吧 ...

嗯嗯是煤,我看文献里面有计算煤红外光谱的,也没有明确什么软件,就自己找到了Gaussian。
谢谢你的回答我应该再多了解了解。
我在win下用甲苯分子做个Opt+Freq做了十分半哈哈
作者
Author:
shiyuyang    时间: 2025-4-6 15:01
Stardust0831 发表于 2025-4-6 13:39
以当前配置、 DFT级别基本上算不动。
可以尝试GFN2-xTB等半经验DFT。(xTB、orca等软件支持)

感谢,让我这个小白明白这么多,没有让我自己一条路走到黑




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