计算化学公社

标题: 请问图中的电荷转移和方向是怎么计算的？ [打印本页]

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-7 17:49
标题: 请问图中的电荷转移和方向是怎么计算的？
本帖最后由 zhangxinxin 于 2025-4-8 17:37 编辑

请问图中的电荷转移和方向是怎么计算的？

作者
Author: Stardust0831 时间: 2025-4-7 17:54
本帖最后由 Stardust0831 于 2025-4-7 17:58 编辑

算出原子电荷，把每个片段的原子电荷加起来就得到这个片段在结合后得到/失去的电子数。
原子电荷的选择可以参考《一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表！》，我个人一般会用Mulliken电荷。
计算流程可以参考：《使用Multiwfn计算分子的某个片段的电荷》，选出片段对应的序号、使用multiwfn读取复合物对应的波函数文件，然后使用multiwfn分析就可以。

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-7 17:59

Stardust0831 发表于 2025-4-7 17:54
算出原子电荷，把每个片段的原子电荷加起来就得到这个片段在结合后得到/失去的电子数。
原子电荷的选择可 ...

谢谢1、MULLIKEN电荷出来的结果不是已经是净电荷的结果了吗？还需要自己加减原子电荷？
2、mulliken电荷需要先结构优化到6-311再单点能优化吗？

作者
Author: Stardust0831 时间: 2025-4-7 18:03

zhangxinxin 发表于 2025-4-7 17:59
谢谢1、MULLIKEN电荷出来的结果不是已经是净电荷的结果了吗？还需要自己加减原子电荷？
2、mulliken电荷 ...

1.需要把每个片段所有原子对应的MULLIKEN电荷加起来，就是这个片段带的电荷数（也就是被转移走/获得的电子数）
2.没有叫“6-311”的东西。计算原子电荷前需要结构优化。可以换个更好的基组再算个单点，结构优化基组够大的话，也可以直接用结构优化最后一步对应的波函数文件。

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-7 20:00

Stardust0831 发表于 2025-4-7 18:03
1.需要把每个片段所有原子对应的MULLIKEN电荷加起来，就是这个片段带的电荷数（也就是被转移走/获得的电 ...

好的谢谢纠正 1、您说还需要把原子对应电荷加起来？之前不是已经选中了对应片段吗？图片上计算出来的不就是已经加和的结果了吗？还需要自己再加一次？

作者
Author: Stardust0831 时间: 2025-4-7 20:20

zhangxinxin 发表于 2025-4-7 20:00
好的谢谢纠正 1、您说还需要把原子对应电荷加起来？之前不是已经选中了对应片段吗？图片上计算出来的不就 ...

你拿到的数据就是加好了的，加起来这步软件帮你完成了。
直接用加和的结果。

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-7 21:13

Stardust0831 发表于 2025-4-7 20:20
你拿到的数据就是加好了的，加起来这步软件帮你完成了。
直接用加和的结果。

但算出来的结果和别人的文献的相差有点大，是因为什么呢？选的分子片段是一样的

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-7 21:20

Stardust0831 发表于 2025-4-7 20:20
你拿到的数据就是加好了的，加起来这步软件帮你完成了。
直接用加和的结果。

就是和我想要的结果不太一样

，该转的多的并不多，理想中转移的少的反而转的电荷多

作者
Author: Stardust0831 时间: 2025-4-7 21:58

zhangxinxin 发表于 2025-4-7 21:13
但算出来的结果和别人的文献的相差有点大，是因为什么呢？选的分子片段是一样的

构象和计算级别是否一致？是否选用了同一种原子电荷？
《谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因》

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-7 22:08

Stardust0831 发表于 2025-4-7 21:58
构象和计算级别是否一致？是否选用了同一种原子电荷？
《谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因 ...

同一种原子电荷是指自己所选片段和别人选的片段一致的意思？片段是一致的。
构象能看出来别人的？

作者
Author: Stardust0831 时间: 2025-4-7 22:21

zhangxinxin 发表于 2025-4-7 22:08
同一种原子电荷是指自己所选片段和别人选的片段一致的意思？片段是一致的。
构象能看出来别人的？

问题一：确保文献里算的原子电荷也是Mulliken电荷，而不是其他类型的原子电荷。原子电荷的定义要一致。
问题二：确保和文献里用的是同一种构象。必要时可以考虑做构象搜索《使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索》

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-7 22:32
好的谢谢您！非常感谢

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-7 22:33

Stardust0831 发表于 2025-4-7 22:21
问题一：确保文献里算的原子电荷也是Mulliken电荷，而不是其他类型的原子电荷。原子电荷的定义要一致。
...

好的谢谢您！非常感谢

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-8 11:50

Stardust0831 发表于 2025-4-7 17:54
算出原子电荷，把每个片段的原子电荷加起来就得到这个片段在结合后得到/失去的电子数。
原子电荷的选择可 ...

您分享的这个计算电荷的视频例子用的是ADCH电荷分布，mulliken电荷分布也能用multiwfn分析吗

作者
Author: Stardust0831 时间: 2025-4-8 12:01

zhangxinxin 发表于 2025-4-8 11:50
您分享的这个计算电荷的视频例子用的是ADCH电荷分布，mulliken电荷分布也能用multiwfn分析吗

可以

作者
Author: imasen 时间: 2025-4-8 13:10
搞清楚自己计算的是片段或者化合物间因为结合导致的电荷转移，还是电子激发过程中片段间的电荷转移。你上面的Multiwfn窗口显示的是后者，但上面这个同学回答的是前者。你展示的文献中的图没有说明是哪一种。

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-8 15:45

imasen 发表于 2025-4-8 13:10
搞清楚自己计算的是片段或者化合物间因为结合导致的电荷转移，还是电子激发过程中片段间的电荷转移。你上面 ...

哦哦对，我算的应该是化合物的两个分子间因为结合导致的电荷转移，这个是不是不能用这个分析

作者
Author: imasen 时间: 2025-4-8 16:59

zhangxinxin 发表于 2025-4-8 15:45
哦哦对，我算的应该是化合物的两个分子间因为结合导致的电荷转移，这个是不是不能用这个分析

假设你的化合物是A和B，首先计算复合物A+B的原子电荷，其中原子电荷的定义有很多方式，之前别人已经回答过你了。如果你想知道A到B转移了多少电荷，对复合物中A片段的所有原子电荷求和，减去孤立的A的总电荷（中性分子就是0，离子就是对应的离子电荷），得到的就是复合物形成过程中A损失的电荷，也就是转移给B的电荷。有了复合物的原子电荷，后面这部分不需要借助计算化学程序，在excel里拉一拉就完了。

作者
Author: zhangxinxin 时间: 2025-4-8 17:25

imasen 发表于 2025-4-8 16:59
假设你的化合物是A和B，首先计算复合物A+B的原子电荷，其中原子电荷的定义有很多方式，之前别人已经回答 ...

我明白啦，我用mulliken算出来了每个原子的。然后进行了加和，谢谢您！

作者
Author: Wyk_ 时间: 2025-7-17 19:17

zhangxinxin 发表于 2025-4-7 20:00
好的谢谢纠正 1、您说还需要把原子对应电荷加起来？之前不是已经选中了对应片段吗？图片上计算出来的不就 ...

你好，我想问一下你这个页面是怎么出来的，我按照视频里的步骤得出来不是这样的页面

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