计算化学公社

标题: 求助,这个还原消除的过渡态始终优化不出来,想问一下大家有什么好办法吗? [打印本页]

作者
Author:
HexSona    时间: 2025-4-8 13:32
标题: 求助,这个还原消除的过渡态始终优化不出来,想问一下大家有什么好办法吗?
如图所示,这里有两个四元环中间体,分别发生还原消除反应,即经过如下过渡态转化为三元环产物。其中,过渡态TS1是可以优化出来的(其log文件有点大,发不出来,我把最后一帧的结构保存并将坐标放下面了),但是,无论如何模仿TS1的结构构建过渡态TS2,都无法优化出理想结果,要么是C--N直接成键得到产物,要么是重新变回四元环中间体。冻结键长的限制性优化也做过了,但是一解冻就“原形毕露”。请问各位有什么好办法吗?










%chk=TS1.chk
%mem=40GB
%nprocshared=28
#p opt=(calcfc,ts,noeigen) freq=noraman b3pw91/genecp em=gd3 gfinput

opt

1 1
Cu                 0.85107400    0.32952900    0.20132800
O                  4.06011800    2.17179700    1.81324400
C                  4.00613600    1.12086200    2.81233000
C                  3.21669800   -0.01024300    2.12664700
N                  2.61662100    0.69289000    0.97092500
C                  3.17413900    1.84812600    0.87114500
N                  0.56807800    2.37224900   -0.38447400
C                 -0.54378800    2.89762800   -1.21686500
C                  0.19782600    3.42027200   -2.45831400
O                  1.57579100    3.55328400   -2.00406800
C                  1.65710500    2.85792700   -0.86684600
C                  3.04266100    2.84390100   -0.25652700
C                  3.32110600    4.27723000    0.25020700
C                  4.09703300    2.45038500   -1.31681200
C                  4.05634200   -1.23596800    1.69225500
C                  3.13830500   -2.23272700    0.98109800
C                  4.62623600   -1.89970600    2.95360000
C                  5.18587600   -0.81943700    0.74372000
C                 -1.38108700    3.96525000   -0.46250900
C                 -2.54022000    4.39084900   -1.37557200
C                 -1.96905400    3.35034700    0.81187900
C                 -0.52679800    5.18022900   -0.08129800
H                  3.49206500    1.52956200    3.68717100
H                  5.03336900    0.87076100    3.07748600
H                  2.40290100   -0.36041400    2.76749100
H                 -1.19887300    2.06463800   -1.48462100
H                  0.19189800    2.70307200   -3.28064900
H                 -0.12042200    4.40163800   -2.80941000
H                  2.63651800    4.55027700    1.05816200
H                  4.34440100    4.34868200    0.62526500
H                  3.19358500    4.98340800   -0.57346700
H                  5.09405300    2.47061000   -0.86726200
H                  3.90622800    1.44372300   -1.69578800
H                  4.06821400    3.15735200   -2.14904000
H                  3.70509900   -3.11241300    0.65835200
H                  2.68204900   -1.78850000    0.09345300
H                  2.33431500   -2.56990000    1.64234300
H                  5.15868900   -2.81886400    2.68564000
H                  5.33926600   -1.25827000    3.48445500
H                  3.82460100   -2.16932600    3.65243200
H                  4.78014500   -0.38573700   -0.17585000
H                  5.87108500   -0.09335600    1.19719400
H                  5.78126000   -1.69420500    0.46046300
H                 -3.18498000    5.10695000   -0.85388800
H                 -2.19318600    4.87878400   -2.29370100
H                 -3.15558000    3.52829000   -1.65725300
H                 -2.57299400    4.08813400    1.35151600
H                 -1.17212900    3.01678900    1.48567600
H                 -2.62775500    2.50481400    0.58234200
H                  0.28046800    4.89537600    0.60262000
H                 -0.07782100    5.66886900   -0.95332400
H                 -1.14237600    5.92867800    0.42942300
N                 -0.61283300   -1.02024000   -0.58288500
C                  2.44998000   -0.79877100   -2.56723900
C                  3.73529100   -1.33068300   -2.63327100
C                  3.96371100   -2.69572000   -2.42803100
C                  2.86509400   -3.52826600   -2.16397800
C                  1.57696700   -3.01782500   -2.08181800
C                  1.38664100   -1.64931000   -2.27653100
H                  2.25908200    0.25276300   -2.75646000
H                  4.57308400   -0.67765100   -2.86439100
H                  3.02612500   -4.59318100   -2.01621900
H                  0.73161400   -3.66438700   -1.87459400
C                  5.35316000   -3.26717500   -2.46748200
H                  5.40058500   -4.15238200   -3.11117200
H                  6.08314200   -2.53992700   -2.83397100
H                  5.66749200   -3.58071000   -1.46380900
S                 -0.25864300   -0.98619100   -2.25081400
O                 -0.19682700    0.37018300   -2.80578200
O                 -1.17563000   -1.96918900   -2.83206000
C                 -1.96432700   -1.04434600   -0.02359400
C                 -1.10066600   -0.16997500    0.83997100
H                 -1.34066200    0.88525200    0.73051300
O                 -2.33293800   -2.24583700    0.51028600
Si                -3.11039300   -3.59318500   -0.20034700
C                 -3.94796500   -4.37120600    1.28079800
H                 -4.47536100   -5.29071400    1.00165500
H                 -3.22006500   -4.62370600    2.06031800
H                 -4.67909400   -3.67884700    1.71344900
C                 -4.32959200   -3.07718000   -1.52059700
H                 -3.81451400   -2.63954500   -2.38111400
H                 -4.87784400   -3.96196700   -1.86835500
H                 -5.05909200   -2.35068200   -1.14829200
C                 -1.77997000   -4.70046900   -0.92275500
H                 -0.94245500   -4.82454300   -0.22587500
H                 -2.17933900   -5.69660600   -1.14788800
H                 -1.40699500   -4.26635200   -1.85583100
C                 -0.48114300   -0.57978800    2.11242900
C                 -0.29239200    0.41266200    3.09266200
C                 -0.14549500   -1.91322600    2.40652200
C                  0.20115400    0.07595600    4.34936700
H                 -0.54872200    1.44241700    2.86257100
C                  0.35516300   -2.23897900    3.66212800
H                 -0.27412600   -2.66777600    1.64123100
C                  0.52449700   -1.25151600    4.63697200
H                  0.32861000    0.84718500    5.10373500
H                  0.61174100   -3.27079100    3.88497200
H                  0.90790300   -1.51725900    5.61817600
C                 -4.36494800    0.97609200   -2.28635600
C                 -5.25035900    1.46498000   -1.36071100
C                 -5.12304600    1.11615200    0.00821700
C                 -4.06574800    0.24166800    0.42006000
C                 -3.12807900   -0.22020100   -0.56728600
C                 -3.29915000    0.13888700   -1.88490300
H                 -6.81730700    2.29481100    0.64527600
H                 -4.46827100    1.22870600   -3.33759400
H                 -6.06200500    2.12257700   -1.66232600
C                 -6.02226100    1.63102300    0.97652400
C                 -3.98456600   -0.09857900    1.79881700
H                 -2.63981600   -0.23061000   -2.65503300
C                 -4.87231400    0.42262400    2.71350100
C                 -5.89827300    1.30157000    2.30511500
H                 -3.23961700   -0.80914900    2.13785900
H                 -4.78916600    0.14163300    3.75997300
H                 -6.59284200    1.70320400    3.03741000


C O N H S Si 0
6-31G*
****
Cu 0
SDD
****

Cu 0
SDD






作者
Author:
wzkchem5    时间: 2025-4-8 14:42
考虑分步机理的可能性,Cu-C键异裂,得到TMSO稳定的碳正,然后Cu-N的N再进攻碳正得到产物
作者
Author:
HexSona    时间: 2025-4-8 16:16
wzkchem5 发表于 2025-4-8 14:42
考虑分步机理的可能性,Cu-C键异裂,得到TMSO稳定的碳正,然后Cu-N的N再进攻碳正得到产物

好的,非常感谢您的提醒,我这就去尝试一下




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3