计算化学公社

标题: 求助CP2K输出动力学的Wannier信息 [打印本页]

作者
Author: Garrett 时间: 2025-4-9 19:56
标题: 求助CP2K输出动力学的Wannier信息
....

[管理员注：原贴内容后来被楼主自己改没了]

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-9 23:25
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “CP2K输出信息” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

我不知道你的目的是什么，CP2K的轨道定域化往往表现得不稳健。用Multiwfn载入CP2K输出的molden文件，按下文做轨道定域化（对周期性体系等同于产生最大定域化Wannier函数），同样可以产生定域化轨道的中心位置
Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比
http://sobereva.com/380（http://bbs.keinsci.com/thread-6053-1-1.html）
详谈使用CP2K产生给Multiwfn用的molden格式的波函数文件
http://sobereva.com/651（http://bbs.keinsci.com/thread-31827-1-1.html）

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-4-9 23:58
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-4-10 14:28 编辑

sobereva 发表于 2025-4-9 23:25
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

或许楼主想通过分子动力学结合TRAVIS获得红外光谱，所以即使是三个水分子也尝试拿CP2K在15埃盒子里做周期性计算……这算不算少数不适合拿ORCA跑小型孤立体系AIMD的场合呢？在ORCA论坛搜TRAVIS也没看到多少讨论（倒是有一个又聊回了CP2K），不知道ORCA现在有没有方便的接口或者至少是能输出相关的文件。

编辑：1楼内容不知为何被编辑掉了，原来楼主是希望CP2K输出动力学的“轨迹、Wannier信息和Voronoi信息”，我是搜索这几个关键词才产生的对计算目标的猜想。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-10 00:27

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-4-9 23:58
或许楼主想通过分子动力学结合TRAVIS获得红外光谱，所以即使是三个水分子也尝试拿CP2K做周期性计算……这 ...

动力学产生红外光谱是很简单的事，TRAVIS完全不是唯一能用的。实际上在北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/KFP）里演示的单分子做AIMD获得红外光谱的例子，用的也是其它的工具（calc-ir-spectra.py脚本。这种小脚本/程序在网上多的是）。只要动力学过程中能给出每一帧的偶极矩信息，都可以用这个python脚本或网上很多类似的脚本/程序产生红外光谱，用ORCA跑AIMD也一样。三个水跑动力学获得红外光谱的目的我会优先用ORCA跑

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-10 14:39
由于帖子标题被作者改成了莫名其妙的“...”，导致别人无法根据帖子主题看到他人有价值的回帖，我重新编辑了贴子标题

顺带提醒楼主，别胡乱改帖子标题。下次再这样扣分处理。

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