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标题: amber读取轨迹文件和crd文件失败 [打印本页]

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lujun    时间: 2017-3-11 01:36
标题: amber读取轨迹文件和crd文件失败
我用amber进行了相关计算,top文件等在生存过程中都没有报错。我计算了一个能量最小化,计算没有问题,最终的输出文件也没有问题。但是我尝试读取crd文件时出错:
Error: Could not read restart atoms/time
我使用的命令是:
ambpdb -p am_crown.prmtop < am_crown_min.crd > am_crown_min_final.pdb
不能读取这个crd文件。
后面我继续做md时,输出文件也是正常的,但是轨迹文件用vmd读取也有问题,报错。
我把我的附件都列在上面了。





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