计算化学公社

标题: 用CP2K几何优化ZnO(001),晶体表面结构形变怎么解决? [打印本页]

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THY    时间: 2025-4-14 10:10
标题: 用CP2K几何优化ZnO(001),晶体表面结构形变怎么解决?
本帖最后由 THY 于 2025-4-14 22:11 编辑

各位老师好,本人使用CP2K对ZnO(001)进行几何优化,cif文件是在MS软件中建模并导出的,切面001,做4x4超胞,真空层15埃,一共128个原子。

CP2K使用的基组是DZVP-MOLOPT-SR-GTH,方法是PBE,开启了smearing,并且固定下方两层共64个原子,k点默认gamma,在这种设置下,优化出来的ZnO表面有不规则的原子凸起,然而使用MS优化的结果是非常规则的表面,请问这种情况如何解决?

附上了MS优化后的晶体结构(左图)和CP2K优化后的晶体结构(右图),以及CP2K的inp文件和out文件。



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Assiduitas    时间: 2025-4-14 14:26
两个软件不一样,计算结果就是有可能有差异的。
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THY    时间: 2025-4-14 20:25
Assiduitas 发表于 2025-4-14 14:26
两个软件不一样,计算结果就是有可能有差异的。

这个差距应该不会这么大
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HydroKagami    时间: 2025-4-15 20:34
根据你的inp文件,你在CP2K使用的是PBE-D3(BJ),使用Dmol3计算的时候加色散校正了吗

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THY    时间: 2025-4-15 21:13
HydroKagami 发表于 2025-4-15 20:34
根据你的inp文件,你在CP2K使用的是PBE-D3(BJ),使用Dmol3计算的时候加色散校正了吗

加了
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THY    时间: 2025-4-15 21:26
标题: 用CP2K计算不同超胞下ZnO(001),其表面结构发生畸变,怎么解决?
本帖最后由 THY 于 2025-4-15 21:36 编辑

各位老师,本人使用CP2K做 ZnO(001)的几何优化,分别建立了3x3   4x4   5x5三个超胞结构,层数都是4层,并且都对最下方两层进行固定。
但是目前出现一个现象就是4x4的这个结构,它几何优化后,其表面的结构发生畸变,而3x3   5x5没有这种现象,请问是这是为什么

三种结构用的都是相同的计算参数。对角化,基组DZVP-MOLOPT-SR-GTH ,理论方法PBE,开启smearing,k点保持gamma,冻结最下方两层原子,开启色散校正D3(BJ)(不过这个开不开结果都一样)

而且由于4x4这个结构表面发生畸变,它的计算时间远大于其他两个

另外上传了三个结构的inp文件,请老师们检查

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