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标题: 求助使用gromacs模拟金属Co和二甲基咪唑自组装过程的力场 [打印本页]

作者
Author: yjb 时间: 2025-4-14 17:32
标题: 求助使用gromacs模拟金属Co和二甲基咪唑自组装过程的力场
各位老师，请问gromacs有什么力场支持包含金属Co离子和有机分子的自组装过程模拟？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-15 03:58
如果是中途形成配位键，gromacs没有力场能支持。应当用CP2K跑第一性原理动力学

作者
Author: yjb 时间: 2025-4-24 17:13

sobereva 发表于 2025-4-15 03:58
如果是中途形成配位键，gromacs没有力场能支持。应当用CP2K跑第一性原理动力学

老师，针对这样的体系，有建议的泛函和基组吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-24 18:31

yjb 发表于 2025-4-24 17:13
老师，针对这样的体系，有建议的泛函和基组吗？

PBE-D3(BJ)/DZVP-MOLOPT-SR-GTH

耗时极低的GFN1-xTB也可以试试（也可以作为昂贵的DFT的AIMD之前的测试），但未必能保证结果定性正确

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