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标题: 怎么用VMD画和以下图片中类似的偶极矩图,怎么确定正电中心和负电中心 [打印本页]

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木鱼    时间: 2025-4-15 16:05
标题: 怎么用VMD画和以下图片中类似的偶极矩图,怎么确定正电中心和负电中心
(, 下载次数 Times of downloads: 22)

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sobereva    时间: 2025-4-16 04:34
Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量
Multiwfn载入fch文件后,主功能300的子功能5也可以算偶极矩矢量
之后用VMD的绘图命令自己绘制箭头,参考下文的脚本里牵扯的绘制命令
使用Multiwfn计算分子片段的偶极矩和复合物中单体的偶极矩
http://sobereva.com/558http://bbs.keinsci.com/thread-18068-1-1.html
(或者直接把整个体系作为一个片段,直接按上文的做法画图)

该写在正文里的内容别就光写在标题里

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木鱼    时间: 2025-4-16 13:18
sobereva 发表于 2025-4-16 04:34
Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量
Multiwfn载入fch文件后,主功能300的子功能5也可以算偶极 ...

好的好的,感谢回复
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木鱼    时间: 2025-4-16 13:21
sobereva 发表于 2025-4-16 04:34
Gaussian算完了之后输出文件里直接读偶极矩矢量
Multiwfn载入fch文件后,主功能300的子功能5也可以算偶极 ...

VMD显示的偶极矩指向和高斯显示的偶极矩方向不一样,如何想和高斯里面的方向一致,应该怎么做呢
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sobereva    时间: 2025-4-17 14:58
木鱼 发表于 2025-4-16 13:21
VMD显示的偶极矩指向和高斯显示的偶极矩方向不一样,如何想和高斯里面的方向一致,应该怎么做呢

分清楚输入朝向和标准朝向的偶极矩,看下文了解朝向问题
谈谈Gaussian中的对称性与nosymm关键词的使用
http://sobereva.com/297http://bbs.keinsci.com/thread-1355-1-1.html




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