计算化学公社

标题: 求助CP2K算出的能量并不与JARVIS数据集中相同的问题 [打印本页]

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yangzexi19    时间: 2025-4-23 14:39
标题: 求助CP2K算出的能量并不与JARVIS数据集中相同的问题
尊敬的各位老师:

您好

发表这个贴子的目的是想询问一下为什么CP2K算出的总能量并不与数据集中给出的总能量相同,我想询问我的计算方法是否有误。

在JARVIS数据集中,JVASP-582的总能量是-4.17391eV/atom,一共是12个原子,也就是-49eV左右,运用的方法是optb88vdw。

但是用cp2k算出来的结果是-304.080417195797396 Hartree。

具体的晶体结构文件,cp2k的输入文件,cp2k的输出文件如下所示。

烦请各位老师指导

此致

敬礼



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sobereva    时间: 2025-4-23 15:06
不同级别算的绝对能量完全没有可比性,赝势的核尺寸不同的情况下绝对能量的数量级都往往不同。此外,晶胞的能量和平均每原子的能量也是两码事
作者
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yangzexi19    时间: 2025-4-25 10:24
sobereva 发表于 2025-4-23 15:06
不同级别算的绝对能量完全没有可比性,赝势的核尺寸不同的情况下绝对能量的数量级都往往不同。此外,晶胞的 ...


卢老师我想请问,平均每原子的能量应该是怎么算的,cp2k可以计算吗?可以计算的话应该怎么操作,谢谢老师回复!
作者
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sobereva    时间: 2025-4-25 11:43
yangzexi19 发表于 2025-4-25 10:24
卢老师我想请问,平均每原子的能量应该是怎么算的,cp2k可以计算吗?可以计算的话应该怎么操作,谢谢老 ...

算晶胞得到的能量除以原子数目
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yangzexi19    时间: 2025-4-25 12:09
sobereva 发表于 2025-4-25 11:43
算晶胞得到的能量除以原子数目

谢谢您的回复,但是我刚入门这个领域,不太懂晶胞的能量怎么计算,我仔细搜了一些帖子,也没有找到,能麻烦您告知一下怎么计算晶胞的能量吗,谢谢卢老师。
作者
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sobereva    时间: 2025-4-25 12:33
yangzexi19 发表于 2025-4-25 12:09
谢谢您的回复,但是我刚入门这个领域,不太懂晶胞的能量怎么计算,我仔细搜了一些帖子,也没有找到,能麻 ...

北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)、http://bbs.keinsci.com/thread-53062-1-1.html

正经学一遍自然就会了。基本的计算知识绝对不是靠三言两语在论坛上能说明白的,更何况CP2K不是傻瓜式程序,正确使用要学习的知识极多。
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myDFT0718    时间: 2025-11-18 10:00
楼主解决这个问题了吗?如果只是除以原子数量,得到的平均原子能量和vasp等软件差异巨大。这是因为CP2K算的是绝对能量,vasp是相对能量。
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yangzexi19    时间: 2025-12-26 08:54
myDFT0718 发表于 2025-11-18 10:00
楼主解决这个问题了吗?如果只是除以原子数量,得到的平均原子能量和vasp等软件差异巨大。这是因为CP2K算的 ...

没有解决,我用VASP计算的平均原子能量与数据集中的也不相同。。。。
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chenzhe    时间: 2025-12-26 09:09
yangzexi19 发表于 2025-12-26 08:54
没有解决,我用VASP计算的平均原子能量与数据集中的也不相同。。。。

Sob老师都说了,没有对比性,因为能量参考零点本来就是程序任意选择的。你只能对比相对能量,比如构型A-构型B的能量差
作者
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yangzexi19    时间: 2025-12-26 09:28
chenzhe 发表于 2025-12-26 09:09
Sob老师都说了,没有对比性,因为能量参考零点本来就是程序任意选择的。你只能对比相对能量,比如构型A- ...

那我想请教一下,要怎样才能计算出JARVIS数据集中的结果,我看他描述也是通过VASP计算的,所以这个是我的困惑。是不是cp2k就无法复现出数据集的结果
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chenzhe    时间: 2025-12-28 20:15
本帖最后由 chenzhe 于 2025-12-28 20:18 编辑
yangzexi19 发表于 2025-12-26 09:28
那我想请教一下,要怎样才能计算出JARVIS数据集中的结果,我看他描述也是通过VASP计算的,所以这个是我的 ...

当然可以。但是计算化学里面最基本的概念就是能量参考点的问题,本来只有相对能量才有意义,这种绝对能量值就没啥用,根本不存在说复现不复现的问题的。你要愿意你开发一个程序把C原子能量定成1百万 Ha,也丝毫不影响结果。你只能看相对差值。没什么好困惑的,因为这个数值本来就是任意定的。非得要对比,你得把两者能量参考点平移了。比如你用vasp算出晶胞能量为100,cp2k是1000,你把cp2k的能量同减去900就是了。




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