计算化学公社
标题:
cp2k绘制周期性模型静电势,VMD闪退,应当如何解决?
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作者Author:
kaikai
时间:
2025-4-23 20:59
标题:
cp2k绘制周期性模型静电势,VMD闪退,应当如何解决?
各位老师好,使用cp2k计算Al2O3表面模型。计划对其分析表面静电势,生成了ELECTRON_DENSITY.cub和hartree.cub文件,文件路径也没有中文,使用卢老师绘制单层COF的方法进行静电势绘制,先试用
培训班
中的COF文件进行尝试,直接使用CP2K_ESP.tcl脚本实现完美复现,再对自己的计算文件进行尝试,发现VMD卡了一会后直接闪退。后来尝试先载入Al2O3-2H-ELECTRON_DENSITY-1_0.cube,此时VMD中的ID=0,再将Al2O3-2H-v_hartree-1_0.cube载入ID=0体系中,此时VMD也是卡了一会后闪退,计算文件放到了附件中,计算结果太大,就放入到了网盘中,因此请教一下给位老师:
1、是我的文件太大了吗?所以在导入VMD的时候卡死了
2、需要修改哪些参数才能够实现静电势的计算?比如调整计算参数还是VMD显示静电势上下限范围?
阿里云盘链接:
https://www.alipan.com/s/rng23SURun2
作者Author:
sobereva
时间:
2025-4-23 21:14
如果用的VMD 1.9.3 32bit版,尝试VMD 1.9.3 64bit版
作者Author:
kaikai
时间:
2025-4-23 21:40
sobereva 发表于 2025-4-23 21:14
如果用的VMD 1.9.3 32bit版,尝试VMD 1.9.3 64bit版
谢谢老师,更换VMD版本后,成功了
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