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标题: 这个配置跑Gaussian/orca和gromacs可以吗 [打印本页]

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Author: 古与春分 时间: 2025-4-27 16:17
标题: 这个配置跑Gaussian/orca和gromacs可以吗
请问这个工作站配置合理吗？
模拟以分子动力学为主，量化为辅

作者
Author: tonganlhy 时间: 2025-4-27 17:41
本帖最后由 tonganlhy 于 2025-4-27 18:34 编辑

分子动力学和量化对单核性能的要求不同。分子动力学需要单核主频高的。量化如果任务多，核数很关键。
如果你需要同时跑两个分子动力学任务，同时还要兼跑量化，那么妥协一下，这个配置可以，但是表现不如配一台7950X+64G+4080*2 加一台7r32单路。
如果你需要同时跑两个分子动力学任务，量化只是偶尔做做，那么可以配两台7950X+64G+4080。
如果你只需要跑一个分子动力学任务，还希望同时跑量化，那么配一台7950X+64G+4090 加一台7r32单路。
主板可以换成技嘉MZ72-HB2，便宜一点。H12DSi-N6这个价位要小心，正常卖价是比这个高的。
5080目前很多软件的适配性不好，如果要马上上手不建议使用。
另外内存要看一下是不是超频的。
三星固态注意0E问题。

作者
Author: 古与春分 时间: 2025-4-28 09:19
本帖最后由古与春分于 2025-4-28 09:28 编辑

tonganlhy 发表于 2025-4-27 17:41
分子动力学和量化对单核性能的要求不同。分子动力学需要单核主频高的。量化如果任务多，核数很关键。
如果 ...

感谢大神的指点，我是同时跑两个分子动力学任务，量化只是偶尔做做，您看看这个配置可以吗。或者显卡换成4070ti和5070ti合理不C:\Users\15180\Desktop/工作站配置.png

作者
Author: tonganlhy 时间: 2025-4-28 09:37
本帖最后由 tonganlhy 于 2025-4-28 10:01 编辑

古与春分发表于 2025-4-28 09:19
感谢大神的指点，我是同时跑两个分子动力学任务，量化只是偶尔做做，您看看这个配置可以吗。或者显卡换成 ...

你这个方案是不行的。7950X不能用在MZ72-HB2主板上。
你这种情况如果预算低，那么配两台7950X+64G+4080，具体参考http://sobereva.com/444
CPU：AMD Ryzen 9 7950X（16核，散片，集显）
主板：技嘉B650M AORUS ELITE 小雕或者850M
硬盘：企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B) + 500G或者1T固态（系统盘），分子动力学要有机械盘作为数据存储，读写要求倒不高
显卡：RTX4080 super 或者 5080
内存：32GB*2 DDR5-6000

如果预算高
可以配一台
CPU：AMD Ryzen 9 7950X（16核，散片，集显）或者9950X
主板：X670E 或者 X870E，注意选有两个PCIE 5.0 x 8 接口的（一般一个是 x 16，另一个是 x 8，两个显卡就只能都 x 8）
硬盘：企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B) + 500G或者1T固态（系统盘），分子动力学要有机械盘作为数据存储，读写要求倒不高
显卡：RTX4080 super 或者5080 *2 （机箱要买够大可以放两个显卡）
内存：32GB*2 DDR5-6000

加一台单路7K62或者7R32 (如果考虑以后升级，预算也够，也可以7532双路+技嘉MZ72-HB2，以后可以升级到7B13或者7C13双路)
CPU：7R32或者7K62
主板：技嘉MZ32-AR0
硬盘：1T固态*2
内存：16GB*16 DDR4-2666

这样差不多了。

作者
Author: 古与春分 时间: 2025-4-28 10:18

tonganlhy 发表于 2025-4-28 09:37
你这个方案是不行的。7950X不能用在MZ72-HB2主板上。
你这种情况如果预算低，那么配两台7950X+64G+408 ...

感谢大神！！！对于显卡的话，4070 4070ti 4080 5070 5070ti 5080又该如何选择了

作者
Author: tonganlhy 时间: 2025-4-28 10:40

古与春分发表于 2025-4-28 10:18
感谢大神！！！对于显卡的话，4070 4070ti 4080 5070 5070ti 5080又该如何选择了

这个看预算。预算够的话，5080性价比最高，如果可以等软件适配，那没问题。如果不行，那4080 super也不会差多少。预算再不够就逐级下降

作者
Author: 古与春分 时间: 2025-4-28 10:52

tonganlhy 发表于 2025-4-28 10:40
这个看预算。预算够的话，5080性价比最高，如果可以等软件适配，那没问题。如果不行，那4080 super也不会 ...

软件适配是指什么了，不适配的话对packmol、gmx、vmd会有什么影响了

作者
Author: tonganlhy 时间: 2025-4-28 12:27

古与春分发表于 2025-4-28 10:52
软件适配是指什么了，不适配的话对packmol、gmx、vmd会有什么影响了

这个要看具体软件。有些没更新或者你要用旧版本的话5080可能会有问题。如果想保险一点就用4080 super好了。

作者
Author: 古与春分 时间: 2025-4-28 15:02

tonganlhy 发表于 2025-4-28 12:27
这个要看具体软件。有些没更新或者你要用旧版本的话5080可能会有问题。如果想保险一点就用4080 super好了 ...

好的好的，感谢感谢

作者
Author: wbqdssl 时间: 2025-6-16 07:28

tonganlhy 发表于 2025-4-27 17:41
分子动力学和量化对单核性能的要求不同。分子动力学需要单核主频高的。量化如果任务多，核数很关键。
如果 ...

您好，想咨询您一些问题。目前自费购机，预算在1.3W或1.4W左右。需要跑量化和MD。看了一些帖子，发现跑量化，9950X的表现能和单路7R32一样。所以目前考虑9950X+4070ti，如果跑MD任务，就只跑MD；如果跑量化，就只跑量化，不会MD和量化一起跑；也不需要好多个Gaussian任务一起跑，如果9950X能和48核的单路7R32打平手，那我觉得跑量化的要求也能满足，任务一个一个交就是了。所以参照社长的推荐，打算用下面的配置，能否请您看一看有没有可以调整的地方，非常感谢！

CPU：AMD Ryzen 9 9950X（16核，散片，集显）
主板：技嘉B650M AORUS ELITE 小雕
散热器：酷冷至尊T400i简包装 80
显卡：技嘉RTX5070 风魔 12GB 5080元或微星幻影师RTX5070 12G SHADOW 3X OC 5000元
硬盘：希捷银河企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B) 1430
内存：2*48G
电源：先马黑钻850 V4 400
机箱：先马黑洞标准版 280

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Author: tonganlhy 时间: 2025-6-16 11:53

wbqdssl 发表于 2025-6-16 07:28
您好，想咨询您一些问题。目前自费购机，预算在1.3W或1.4W左右。需要跑量化和MD。看了一些帖子，发现跑量 ...

硬盘可以不用那么好的，配一个4T HDD（紫盘，JD大约600）加一个或者两个SSD（一个缓存一个系统）会比较好，量化计算有时候需要比较快的磁盘存储。如果急着开展工作，建议还是上4系的显卡。5系显卡的cuda驱动以及软件配套还不太成熟，可能比较折腾。

作者
Author: wbqdssl 时间: 2025-6-16 12:16

tonganlhy 发表于 2025-6-16 11:53
硬盘可以不用那么好的，配一个4T HDD（紫盘，JD大约600）加一个或者两个SSD（一个缓存一个系统）会比较好 ...

非常感谢您的回复，谢谢！

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