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标题: VMD画dna结构时使用NewRobbons,只显示了一条链 [打印本页]

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1900    时间: 2025-4-28 13:41
标题: VMD画dna结构时使用NewRobbons,只显示了一条链
我用vmd画双链dna结构的时候,使用了NewRobbons,只显示了一条链。报错是ERROR) Warning: ribbons code encountered an unusual structure, geometry may not look as expected.
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sobereva    时间: 2025-4-28 14:02
用诸如CPK方式显示,检查原子坐标和自动判断的键连关系的合理性。并且在结构文件里检查残基名、原子名等信息的合理性
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1900    时间: 2025-4-28 15:42
sobereva 发表于 2025-4-28 14:02
用诸如CPK方式显示,检查原子坐标和自动判断的键连关系的合理性。并且在结构文件里检查残基名、原子名等信 ...

用cpk或者VMD等方式显示都没有问题。坐标和键连关系也没有问题。
作者
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1900    时间: 2025-4-28 16:04
1900 发表于 2025-4-28 15:42
用cpk或者VMD等方式显示都没有问题。坐标和键连关系也没有问题。

我把两条链分开成了两个文件。分别加载到了vmd里面,这样可以用NewRobbons显示了。
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sobereva    时间: 2025-4-28 16:30
正确拼写是NewRibbons
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1900    时间: 2025-5-1 16:12
sobereva 发表于 2025-4-28 16:30
正确拼写是NewRibbons

嗯嗯,感谢纠正。




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