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标题: 福井函数计算f+中显示H位点最可能亲核反应，但是图形化以后H处未显示，这种有办法嘛 [打印本页]

作者
Author: gwh1206 时间: 2025-4-28 21:23
标题: 福井函数计算f+中显示H位点最可能亲核反应，但是图形化以后H处未显示，这种有办法嘛
在福井函数计算f+中显示H位点最可能亲核反应，但是在图中，H处没有任何显示，可以通过调整等值面来使得H出显示亲核嘛？不知道这种是否合理。
如果可以，我是否可以将轨道权重双描述符的图形也通过调整使得H显示出亲核？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-4-28 22:16
分清楚福井函数和简缩福井函数，看下文第6部分
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）
以及
亲电取代反应中活性位点预测方法的比较（http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract28694.shtml）、Comparative study on the methods for predicting the reactive site of nucleophilic reaction（https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11426-015-5494-7）

减小等值面数值，以及把原子球取消显示避免挡着，总能显示出来

作者
Author: gwh1206 时间: 2025-4-29 18:15

sobereva 发表于 2025-4-28 22:16
分清楚福井函数和简缩福井函数，看下文第6部分
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com ...

谢谢老师的指正！

作者
Author: gwh1206 时间: 2025-5-1 20:18

sobereva 发表于 2025-4-28 22:16
分清楚福井函数和简缩福井函数，看下文第6部分
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com ...

老师您好，我把简缩双描述符绘制的等值面减少数值后，在H位显示均为蓝色，按我的理解蓝色代表负值即更容易发生亲电反应。但是在表中H的简缩双描述符数值几乎均是正值，理应更容易发生亲核反应。想请教一下老师这种情况。感谢老师的赐教！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-5-1 22:46

gwh1206 发表于 2025-5-1 20:18
老师您好，我把简缩双描述符绘制的等值面减少数值后，在H位显示均为蓝色，按我的理解蓝色代表负值即更容 ...

怀疑你作图有问题
没有你给Multiwfn的概念密度泛函计算功能用的wfn文件我没法重复你的结果检查是怎么回事

作者
Author: gwh1206 时间: 2025-5-2 14:26

sobereva 发表于 2025-5-1 22:46
怀疑你作图有问题
没有你给Multiwfn的概念密度泛函计算功能用的wfn文件我没法重复你的结果检查是怎么回 ...

老师您好！这是我相关的计算文件。麻烦老师您帮忙检查一下问题，十分感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-5-2 21:34

gwh1206 发表于 2025-5-2 14:26
老师您好！这是我相关的计算文件。麻烦老师您帮忙检查一下问题，十分感谢！

你的等值面数值用得还不够小。改成0.001时能看到condensed CDD为正的H25附近有一大片正值区域。这明显有里德堡特征。即N+1状态相对于N额外加入的电子倾向于分布在离原子核较远的区域。
(, 下载次数 Times of downloads: 24)

从1.fch看到LUMO轨道的概率密度也同样可以发现这是极为弥散的里德堡轨道。饱和烷烃的LUMO一般都是里德堡轨道。
(, 下载次数 Times of downloads: 27)

如果对里德堡轨道不了解，看下文
图解电子激发的分类
http://sobereva.com/284（http://bbs.keinsci.com/thread-840-1-1.html）

作者
Author: gwh1206 时间: 2025-5-2 22:18

sobereva 发表于 2025-5-2 21:34
你的等值面数值用得还不够小。改成0.001时能看到condensed CDD为正的H25附近有一大片正值区域。这明显有 ...

感谢老师的解答和赐教！新知识+1！还是想向您确认一下，是否可以通过CDD图结合表格数据来说明这里是亲核反应发生的位点。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-5-2 22:37

gwh1206 发表于 2025-5-2 22:18
感谢老师的解答和赐教！新知识+1！还是想向您确认一下，是否可以通过CDD图结合表格数据来说明这里是亲核 ...

不能盲目这么判断
先得明确这个体系有可能发生什么亲核反应。如果你关注的亲核反应跟氢没有直接关系，即便氢的CDD多么正也不是你需要关注的

作者
Author: gwh1206 时间: 2025-5-2 23:19

sobereva 发表于 2025-5-2 22:37
不能盲目这么判断
先得明确这个体系有可能发生什么亲核反应。如果你关注的亲核反应跟氢没有直接关系，即 ...

感谢老师的回答！我的体系亲核反应和氢很大概率有关系。
反应方程式和下图一样：聚偏二氟乙烯发生脱氟化氢反应，普遍查阅的文献都是在碱性环境下氢氧根或者碳酸根攻击聚偏二氟乙烯的H位点，进而导致脱氟反应。
因此，想通过Fukui函数来确定亲核反应的位点。

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-5-3 14:12
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-5-3 14:40 编辑

gwh1206 发表于 2025-5-2 23:19
感谢老师的回答！我的体系亲核反应和氢很大概率有关系。
反应方程式和下图一样：聚偏二氟乙烯发生脱氟化 ...

“亲核反应”“亲电反应”太模糊了，亲核和亲电这种标签不会脱离语境单独出现而是用来修饰具体的反应类型的，比如“亲核取代反应”“亲电加成反应”之类，即便概念密度泛函预测/解释反应位点也是同理。当前你的思考方向就不合适，这种简单底物的所有氢的化学环境基本一致（氟也是），因而凭基础有机化学知识即可大致想到氟化氢消除反应怎么发生，并没有太多反应位点/区域选择性好讨论。建议先看看维基对Elimination reaction的介绍，再想想有什么值得讨论的点。

当然，如果消除反应不是唯一的可能，那就得说清楚体系具体是什么条件、有何反应物，再构思可能发生的反应了。直接有针对性地找过渡态、计算自由能等等，再探讨反应难易程度并辅以波函数分析解释，这才是合适的研究思路。

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