计算化学公社

标题: Fpmd模拟中为计算自由能，模拟的时长范围是多少 [打印本页]

作者
Author: JCenter 时间: 2025-4-28 23:47
标题: Fpmd模拟中为计算自由能，模拟的时长范围是多少
在分子力场下跑md模拟，通过增强采样方法计算某一过程的自由能，比如伞状采样、元动力学等，一般情况下总时长跑100-300 ns不等即可。那如果是在cp2k中跑fpmd模拟，使用元动力学方法计算自由能，一般需要考虑跑多久呢，10ps够吗，特此请教下大家。

作者
Author: ljh123 时间: 2025-5-14 16:41
即使是很快发生的反应，10ps大概也就能发生一次正反方向的反应。

作者
Author: JCenter 时间: 2025-5-14 16:59

ljh123 发表于 2025-5-14 16:41
即使是很快发生的反应，10ps大概也就能发生一次正反方向的反应。

我之前请教了一个大佬，说是平衡后跑上百ps,我直接准备跑100ps了，主要是体系太大了（600原子，pbe/dzvp-molopt-sr-gth），100ps估计差不多了吧。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)