计算化学公社

标题: 关于使用Multiwfn做什么可以表征自由基活性高低的咨询？ [打印本页]

作者
Author: ltotorosy 时间: 2017-3-16 17:02
标题: 关于使用Multiwfn做什么可以表征自由基活性高低的咨询？
老师请问，用Multiwfn做静电势图，看各个位点的静电势可以表征出一个自由基活性的高低吗？图中将羟基上的H脱除形成苯氧自由基，是否可以认为O处的静电势越负表明活性越强？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-16 23:43
没有前提的话光从静电势上不好说
得结合具体问题、发生什么反应之类，这样才能判断静电势分析是否有用

作者
Author: 风玲儿 时间: 2017-3-17 09:01

sobereva 发表于 2017-3-16 23:43
没有前提的话光从静电势上不好说
得结合具体问题、发生什么反应之类，这样才能判断静电势分析是否有用

老师，借助楼主的问题，我也想问一下，自由基的spin density是比较的Multiwfn么？如果要看一个分子里某个基团的spin density 又应该怎么看呢

作者
Author: ltotorosy 时间: 2017-3-17 09:19

sobereva 发表于 2017-3-16 23:43
没有前提的话光从静电势上不好说
得结合具体问题、发生什么反应之类，这样才能判断静电势分析是否有用

谢谢老师的回复。昨天看到一篇文献，用H原子或者·OH和溴酚反应，脱除羟基上的H，形成溴酚氧自由基。因为图中Br的取代位置和个数不同，所以请问老师这三个结构脱除羟基上的H的难易程度是不是可以用电子密度分布来分析？看取代基位置和个数对电子密度造成的影响来分析O-H键的强弱？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-18 00:10

风玲儿发表于 2017-3-17 09:01
老师，借助楼主的问题，我也想问一下，自由基的spin density是比较的Multiwfn么？如果要看一个分子里某个 ...

谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353

按照此文，计算原子的自旋布居，把片段里原子的值加和就是片段的自旋布居

要搞清楚自旋布居和自旋密度的差异，你的用词是错误的

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-18 00:19

ltotorosy 发表于 2017-3-17 09:19
谢谢老师的回复。昨天看到一篇文献，用H原子或者·OH和溴酚反应，脱除羟基上的H，形成溴酚氧自由基。因为 ...

关键是O-H键强的问题。可以考察三种情况对O-H键级的影响，或者考察O-H键中间的键临界点处的电子密度数值，从而考察三种情况O-H键的强度

作者
Author: ltotorosy 时间: 2017-3-18 09:24

sobereva 发表于 2017-3-18 00:19
关键是O-H键强的问题。可以考察三种情况对O-H键级的影响，或者考察O-H键中间的键临界点处的电子密度数值 ...

谢谢sob老师的指导。

作者
Author: 风玲儿 时间: 2017-3-20 15:59

sobereva 发表于 2017-3-18 00:19
关键是O-H键强的问题。可以考察三种情况对O-H键级的影响，或者考察O-H键中间的键临界点处的电子密度数值 ...

老师您好，我想用multiwfn计算spin density 结果总是显示cannot not found, input again错误信息

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-20 16:07

风玲儿发表于 2017-3-20 15:59
老师您好，我想用multiwfn计算spin density 结果总是显示cannot not found, input again错误信息

路径没写对
将文件快速载入Multiwfn程序的几个技巧
http://sobereva.com/237

作者
Author: 风玲儿 时间: 2017-3-20 16:12

sobereva 发表于 2017-3-18 00:19
关键是O-H键强的问题。可以考察三种情况对O-H键级的影响，或者考察O-H键中间的键临界点处的电子密度数值 ...

老师还有一个就是我用高斯得到的输出文件中的spin densities 只有一列，那么这些是不是spin density呢

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-20 16:24

风玲儿发表于 2017-3-20 16:12
老师还有一个就是我用高斯得到的输出文件中的spin densities 只有一列，那么这些是不是spin density呢

这叫自旋布居
在“谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算”中特意强调了

作者
Author: 风玲儿 时间: 2017-3-20 16:53

风玲儿发表于 2017-3-20 15:59
老师您好，我想用multiwfn计算spin density 结果总是显示cannot not found, input again错误信息

老师，这些原子的自选布局之和是不是就这个基团的自选密度吗，比如说这个C6H5 自由基的spin density就是1

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-21 01:32

风玲儿发表于 2017-3-20 16:53
老师，这些原子的自选布局之和是不是就这个基团的自选密度吗，比如说这个C6H5 自由基的spin density就是1 ...

自旋密度是三维函数，每个空间位置有一个数值，怎么能说自旋布居之和是自旋密度？完全错误！
仔细看此文理解
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353

作者
Author: 风玲儿 时间: 2017-3-21 09:52
文献中提到的这些又是怎么来的呢

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-21 14:38

风玲儿发表于 2017-3-21 09:52
文献中提到的这些又是怎么来的呢

取spin_pop那一列的值，就是原子自旋布居，把苯上所有原子自旋布居加和就是苯的自旋布居
此文作者是个初学者，没分清楚什么叫自旋密度和自旋布居。

作者
Author: 风玲儿 时间: 2017-3-21 14:51

sobereva 发表于 2017-3-21 14:38
取spin_pop那一列的值，就是原子自旋布居，把苯上所有原子自旋布居加和就是苯的自旋布居
此文作者是个初 ...

哦哦，谢谢老师，原来如此

作者
Author: beidiwu 时间: 2017-4-7 03:22
本帖最后由 beidiwu 于 2017-4-7 03:27 编辑

Formation of bromophenoxy radicals from complete series reactions of bromophenols with H and OH radicals已找到，谢谢！

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