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标题: 求助关于混合基组导致分子结构优化的问题 [打印本页]

作者
Author: Hitomilpc 时间: 2025-5-7 08:36
标题: 求助关于混合基组导致分子结构优化的问题
各位老师好，

我最近在使用ORCA软件进行Ag配合物的结构优化和能量计算。分子体系不大，只有25个左右的原子，包含Ag，C，S，O和H。阅读了一些文献说是使用B3LYP方法，Ag原子使用LANL2DZ基组，然后有机配体的原子使用6-311++G**基组。然后我想尝试着复现一下文献的结果，但是发现做几何优化的过程中，分子中的原子持续向Ag原子塌陷。但当我用单一基组，例如def2-TZVP的话就没有任何问题。想请教一下各位老师，我该从哪些方面去做troubleshooting呢？

谢谢！

作者
Author: Stardust0831 时间: 2025-5-7 09:15
本帖最后由 Stardust0831 于 2025-5-7 09:18 编辑

你大概率忘了Ag的赝势。
对高斯而言，见《详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入》（http://sobereva.com/60）
对orca而言，可以用类似这样的写法加上基组定义和赝势定义：

%basis
NewGTO Ag "LANL2DZ" end
NewECP Ag "LANL2DZ" end
end

吐槽一下、这个级别是教科书版的错误。有机配体部分滥用弥散函数、导致计算耗时激增、scf可能难收敛；赝势基组过差、精度严重过时、导致最后的精度也低的离谱。
见《谈谈赝势基组的选用》（http://sobereva.com/373）

我推荐你结构优化用def2-SVP，这个基组前四周期是全电子基组、第五周期开始是赝势基组，在高斯里写关键词def2svp就能用、在orca里直接写关键词def2-SVP。不需要再自定义基组了。算能量可以def2-TZVP。
def2系列也是orca里最最常用的基组。（pople系列主要是高斯用的，高斯对pople系列有优化、算的会快一点、orca没必要用这个）

作者
Author: Hitomilpc 时间: 2025-5-7 09:17
自己破案了，单加基组是不够的，需要再手动添加ECP "LANL2"才可行

作者
Author: Hitomilpc 时间: 2025-5-7 09:20

Stardust0831 发表于 2025-5-7 09:15
你大概率忘了Ag的赝势。
对高斯而言，见《详解Gaussian中混合基组、自定义基组和赝势基组的输入》（http:/ ...

谢谢老师，我也刚发现了这个问题，以后会注意的

作者
Author: Stardust0831 时间: 2025-5-7 09:22
本帖最后由 Stardust0831 于 2025-5-7 09:29 编辑

Hitomilpc 发表于 2025-5-7 09:17
自己破案了，单加基组是不够的，需要再手动添加ECP "LANL2"才可行

小提醒，这个级别极度不合理。
Ag是过渡金属，b3lyp表现不佳、而且你连色散矫正也不加。看看http://sobereva.com/557你就知道我为什么这么说了。这种情况泛函换成PBE0-D4
看看社长的这篇博文http://sobereva.com/373中对lan2DZ的评价和“关于计算配合物时赝势基组与全电子基组的匹配问题”部分。
同时、你全电子基组滥用了弥散函数，一般不对氢加弥散函数。见：谈谈弥散函数和“月份”基组（http://sobereva.com/119）

结构很小又确实想加弥散函数的话，可以给全体元素都用3zeta基组、给重元素加弥散函数。可以使用ma-def2-TZVP基组。精度比你现在高得多，你也大概率能算动。

作者
Author: Hitomilpc 时间: 2025-5-7 09:27

Stardust0831 发表于 2025-5-7 09:22
小提醒，这个级别极度不合理，
看看社长的这篇博文http://sobereva.com/373中对lan2DZ的评价和“关于计 ...

好的，老师。确实文章中的东西很多都不一定靠谱。我仔细阅读下社长的博文。再次感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2025-5-7 12:57
不要自己在标题里手写【求助】这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给你改了，以后注意

作者
Author: Hitomilpc 时间: 2025-5-7 14:26

sobereva 发表于 2025-5-7 12:57
不要自己在标题里手写【求助】这种标签，http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html里明确说了。这次给 ...

好的，sob老师。下次一定注意，感谢提醒。

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