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标题: 求助：请教如何根据rmsd值选择构建的聚合物模型附文件 [打印本页]

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Author: xuecao 时间: 2025-5-7 21:44
标题: 求助：请教如何根据rmsd值选择构建的聚合物模型附文件
本帖最后由 xuecao 于 2025-5-20 22:24 编辑

根据参考文献，找计算商家堆叠了一个聚合物的模型，这个模型用于相互作用研究商家说10-20ns 的结构比较合理，20-100ns的结构比较松散，建议用10ns 的结构去做研究，图中叠合了一下100ns（紫色）和10ns（绿色）的结构，从rmsd上可以看到前20ns是一种构象，后20-100ns是另外一种构象，商家说100ns的快跑散架了，认为10ns的结构比较可行，本人小白，想请教大家，商家说的对吗？因为后面要发文章，又担心用10ns跑出的结构会被质疑。

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