计算化学公社
标题:
求助:分子动力学模拟高温晶体容易散架怎么办
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作者Author:
Lisy
时间:
2025-5-12 22:36
标题:
求助:分子动力学模拟高温晶体容易散架怎么办
各位老师,我想用gromacs模拟金属原子在二硫化钼晶体中的高温迁移,温度是七百多K,用NPT系综跑的话MoS2晶体总是很容易散架,盒子也会被拉得很长,用NVT系综跑的话金属原子又很难在MoS2中发生迁移,请问有什么解决方法呢
作者Author:
sobereva
时间:
2025-5-13 01:49
如果你的盒子足够大,原子迁移对体系尺寸的影响可以忽略不计,用NVT并无问题
NPT系综下MoS2散架说明力场参数或拓扑信息有问题,完全不是用NPT会必然导致的问题
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