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标题: NVIDIA L20 GPU对gromacs的加速是否建议使用 [打印本页]

作者
Author: jxin 时间: 2025-5-19 12:16
标题: NVIDIA L20 GPU对gromacs的加速是否建议使用
NVIDIA L20 GPU，32vCPU， 256 GB内存
请教一下各位老师，在能够借用到这个配置的条件下，是否建议使用。因为看到多是v100和A100或是RTX3090这些相关的测评，所以对此想稍微确定一下。

作者
Author: student0618 时间: 2025-5-19 12:35
why not just try it first

作者
Author: jxin 时间: 2025-5-19 12:44

student0618 发表于 2025-5-19 12:35
why not just try it first

我想这个借用到如果对我的用处不大的话，徒增一些麻烦、烦恼，也会是一种资源的浪费。

作者
Author: xyan11 时间: 2025-5-20 00:22
Gromacs基本还是用混合精度的多 fp32算力是主要指标

L20纯纸面的fp32性能是59.35 TFLOPS，公版4090纯纸面fp32性能是82.58 TFLOPS，公版5080是56.28 TFLOPS。

看你这配置像是云计算？如果纯省钱的角度如果有游戏卡还是选游戏卡吧毕竟云计算你也不用担心40/50系N卡烧接口的问题

希望有所帮助

作者
Author: k64_cc 时间: 2025-5-20 15:51
本帖最后由 k64_cc 于 2025-5-20 16:21 编辑

L20没有FP64，惊不惊喜，意不意外？实测mixed precision下用L20，结果mean不变，但variance相比4090会暴增。计算自由能，variance 从9 +- 0.5 kcal/mol变成了9 +- 2.5 kcal/mol，构象分布可复现性差得离谱，吓得我还以为自己实现出问题了。

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