pal 发表于 2025-5-20 09:51
表面活性剂的量也不应该按照盒子的体积计算
含光君 发表于 2025-5-20 09:41
这取决于你可不可以接受水层厚度能否有偏差。如果可以,在你本想模拟5nm的水层的情况下,可以在初期填水分 ...
呀芽芽 发表于 2025-5-20 15:43
请问您觉得应该按照什么算呢?我看教程基本都是按盒子体积算的。数量N=c*V*NA,这样算不对吗?
pal 发表于 2025-5-20 16:17
浓度是按照溶液算的,你现在的盒子有一半是真空,用盒子的体积来算,表面活性剂的量显然有问题,比较极端 ...
呀芽芽 发表于 2025-5-20 15:50
您好,如果建完表活结构后用gmx solvate插入水分子的话。我是把两个界面上的所有表面活性剂分子就直接放 ...
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