计算化学公社

标题: VASP几何优化时为什么甲醇分子会断键 [打印本页]

作者
Author: hbw 时间: 2025-5-22 16:52
标题: VASP几何优化时为什么甲醇分子会断键
VASP几何优化时为什么甲醇分子会断键，我是在石墨烯片层上面搭建了两层Pt111面，做完几何优化了，然后在这基础上加入甲醇分子，尝试了几种放置位置，发现甲醇分子的中C的一个H会跑掉，这是什么情况？

作者
Author: wilesyu 时间: 2025-5-22 21:15
C-H靠近Pt，可能在优化时Pt原子吸引H，导致键断裂。试一试让O-H朝向表面，让O与Pt形成较强的相互作用，而C-H远离表面，减少被催化的可能性。（本人小白，不成熟的见解）

作者
Author: hbw 时间: 2025-5-22 21:21

wilesyu 发表于 2025-5-22 21:15
C-H靠近Pt，可能在优化时Pt原子吸引H，导致键断裂。试一试让O-H朝向表面，让O与Pt形成较强的相互作用，而C- ...

我之前是将甲醇分子C=O横着放，结果优化完C=O直接断掉了，然后我把垂直放，C靠近Pt表面结果H又跑掉了

作者
Author: wilesyu 时间: 2025-5-22 22:06

hbw 发表于 2025-5-22 21:21
我之前是将甲醇分子C=O横着放，结果优化完C=O直接断掉了，然后我把垂直放，C靠近Pt表面结果H又跑掉了

可以提供一下POSCAR文件么

作者
Author: Lance先生 时间: 2025-5-23 09:32
软件的显示问题，社长写过一篇判断成键的博文，可以看看

作者
Author: hbw 时间: 2025-5-23 09:58

wilesyu 发表于 2025-5-22 22:06
可以提供一下POSCAR文件么

POSCAR和CONTAR都在这里，明显CONTCAR有个C-H键很远

作者
Author: hbw 时间: 2025-5-23 10:01

Lance先生发表于 2025-5-23 09:32
软件的显示问题，社长写过一篇判断成键的博文，可以看看

但是我横着放甲醇时，是直接跑开很远的，可以看出是断键了

作者
Author: archer 时间: 2025-5-23 15:20
你这个不是Pt(111)面，而是2层Pt原子，建立异质结可以用vaspkit构建。

作者
Author: hbw 时间: 2025-5-23 15:55

archer 发表于 2025-5-23 15:20
你这个不是Pt(111)面，而是2层Pt原子，建立异质结可以用vaspkit构建。

这是我切的Pt111面，然后跟着石墨烯基底一起几何优化的，然后就成下面这个样子了

作者
Author: archer 时间: 2025-5-23 16:26

hbw 发表于 2025-5-23 15:55
这是我切的Pt111面，然后跟着石墨烯基底一起几何优化的，然后就成下面这个样子了

不同晶面不能直接放一起，需要扩胞使得晶格参数匹配，然后放一起

作者
Author: hbw 时间: 2025-5-23 19:06

archer 发表于 2025-5-23 16:26
不同晶面不能直接放一起，需要扩胞使得晶格参数匹配，然后放一起

我是用MS建的模型，然后复制的，对于您说的是异质结的构建，我确实不知道该怎么去晶格匹配，之前尝试过，结果Pt都跑盒子边缘上，还请您不吝赐教

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