计算化学公社

标题: 现在的学生真是不得了（PM3分析轨道系数不靠谱啊） [打印本页]

作者
Author: ggdh 时间: 2017-3-20 22:46
标题: 现在的学生真是不得了（PM3分析轨道系数不靠谱啊）
本帖最后由 ggdh 于 2017-3-21 19:15 编辑

今天上课讲到α-β不饱和醛酮的共轭加成
(, 下载次数 Times of downloads: 25)
讲到，因为LUMO在β位系数较大。而在羰基碳上系数较小。所以轨道作用为主的软碱进攻β位，而静电作用成分比较多的硬碱进攻羰基碳。
结果下课就有个学生，拿着ipad上来跟我说”我刚算了这个分子的LUMO，感觉羰基碳上的分布好像还大一点啊“ 然后把他算的轨道给我看。
我一看，我去，原来ipad还可以提交到MOPAC服务器上算轨道。我真是长知识了。
别人好歹是pm3算的，比我这个Huckel规则算的方法还高级一点。。。
我也是服气。只有等下课用B3LYP算算看了。。

作者
Author: agent99 时间: 2017-3-21 00:39
B3LYP结果怎样呢？这种分子如果Huckel的参数是经过类似分子验证的话，说不定还好过PM3。。。

作者
Author: 元江1994 时间: 2017-3-21 08:56
了不得啊了不得，老师你赶紧拽住他跟他学习怎么用iPad提交的~

作者
Author: jiangning198511 时间: 2017-3-21 08:57
学生主动学习意识强是好事，可以拉来做计算哈哈

作者
Author: 冰释之川 时间: 2017-3-21 09:18
这是本科课程还是研究生课程啊，这学生好厉害

作者
Author: yjcmwgk 时间: 2017-3-21 09:32
呵呵，这样的娃娃很合适啊，抓紧时间拉进课题组嘛！

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2017-3-21 10:13

yjcmwgk 发表于 2017-3-21 09:32
呵呵，这样的娃娃很合适啊，抓紧时间拉进课题组嘛！

这是在说我吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-21 14:39

元江1994 发表于 2017-3-21 08:56
了不得啊了不得，老师你赶紧拽住他跟他学习怎么用iPad提交的~

应该是ssh连的服务器
当年把ipad越狱后也通过ssh向ipad传文件，甚至还能编译程序

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-21 16:27
本帖最后由 liyuanhe211 于 2017-3-21 17:04 编辑

(, 下载次数 Times of downloads: 23)

B3LYP/6-31G(d), Hirshfield orbital composition (LUMO, MO 16)

Atom 1(C ) : 29.096961%
Atom 4(C ) : 15.746400%
Atom 6(C ) : 23.765496%
Atom 8(O ) : 22.371784%

复制代码

PM3 (at B3LYP/6-31G(d) geometry) (LUMO, MO 12) 竟然定性确实是不一样的

Atom 1(C ) : 22.140898%
Atom 4(C ) : 19.702170%
Atom 6(C ) : 26.863879%
Atom 8(O ) : 19.583873%

复制代码

PM6-D3

Atom 1(C ) : 25.155926%
Atom 4(C ) : 18.088675%
Atom 6(C ) : 29.224179%
Atom 8(O ) : 19.789193%

复制代码

图：

依次：B3LYP/6-31G(d), PM3

(, 下载次数 Times of downloads: 23) (, 下载次数 Times of downloads: 38)

结论：PMx的波函数用于波函数分析不靠谱→_→
（不过没有确定Hirshfield的原子电子密度本身有没有关系，但肉眼看上去好像不只是）

作者
Author: ggdh 时间: 2017-3-21 19:08

liyuanhe211 发表于 2017-3-21 16:27
B3LYP/6-31G(d), Hirshfield orbital composition (LUMO, MO 16)

PM3 (at B3LYP/6-31G(d) geometry) ...

哇！太感谢了！我还没来得及算呢。。

作者
Author: ggdh 时间: 2017-3-21 19:14

sobereva 发表于 2017-3-21 14:39
应该是ssh连的服务器
当年把ipad越狱后也通过ssh向ipad传文件，甚至还能编译程序

https://www.webmo.net/
问了下，是连的这个网站算的。能够支持ios和android。这样拿着手机也能看个小分子轨道，静电势什么的。方便啊。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-21 20:23

ggdh 发表于 2017-3-21 19:08
哇！太感谢了！我还没来得及算呢。。

嘿嘿嘿只是好奇

作者
Author: greatzdk 时间: 2017-4-17 18:11
手机也能连何必ipad

作者
Author: lzy0702 时间: 2017-4-18 06:11
话说PMx这样的半经验法算小体系在移动设备上直接算也能算得动吧，有没有不需要联网的app？

作者
Author: lastzealot 时间: 2017-4-23 20:45

liyuanhe211 发表于 2017-3-21 16:27
B3LYP/6-31G(d), Hirshfield orbital composition (LUMO, MO 16)

PM3 (at B3LYP/6-31G(d) geometry) ...

李老师的意思是不是b3lyp更可靠呢？比如，这个体系的合理结果是alpha位被进攻呢还是beta位被进攻呢？
一般是通过将PMx与b3比较来得出PMx结果是否合理的吗？
谢谢

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-4-23 21:26

lastzealot 发表于 2017-4-23 20:45
李老师的意思是不是b3lyp更可靠呢？比如，这个体系的合理结果是alpha位被进攻呢还是beta位被进攻呢？
一 ...

如何进攻合理楼主分析过了。B3LYP虽然说不上可以做参比的程度，但我认为其比PMx半经验可靠是显然的

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