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标题: sobtop结合RESP2给离子液体创建top文件报错:file not found:MOL.ac [打印本页]

作者
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aipacino    时间: 2025-5-23 15:34
标题: sobtop结合RESP2给离子液体创建top文件报错:file not found:MOL.ac
本帖最后由 aipacino 于 2025-5-24 09:00 编辑

各位老师好:
想请教一下我想用gromcas模拟如图所示离子液体吸附二氧化碳分子的过程,用RESP2计算离子液体的电荷后,采用最简单的GAFF用sobtop产生top文件时报错,将阴离子单独处理也一样:
Running: ./atomtype -i "solvent/ilanion/ilanion.mol2" -f mol2 -o MOL.ac -d ATOMTYPE_GFF.DEF ...
Unrecognized atomic name (    1).
forrtl: No such file or directory
forrtl: severe (29): file not found, unit 10, file /home/aipacino/environment/sobtop_1.0/MOL.ac

我用同样的方法产生其他简单有机溶剂分子时能正常工作



作者
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sobereva    时间: 2025-5-24 08:28
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作者
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aipacino    时间: 2025-5-29 10:04
sobereva 发表于 2025-5-24 08:28
上传输入文件

老师您好,这是我的离子液体的输入文件
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sobereva    时间: 2025-5-29 12:03
http://sobereva.com/soft/Sobtop/#FAQ4极为明确说了不能把阴阳离子一起处理

单独拿出来阴离子处理没有任何问题
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