标题: sobtop结合RESP2给离子液体创建top文件报错:file not found:MOL.ac [打印本页] 作者Author: aipacino 时间: 2025-5-23 15:34 标题: sobtop结合RESP2给离子液体创建top文件报错:file not found:MOL.ac 本帖最后由 aipacino 于 2025-5-24 09:00 编辑
各位老师好:
想请教一下我想用gromcas模拟如图所示离子液体吸附二氧化碳分子的过程,用RESP2计算离子液体的电荷后,采用最简单的GAFF用sobtop产生top文件时报错,将阴离子单独处理也一样:
Running: ./atomtype -i "solvent/ilanion/ilanion.mol2" -f mol2 -o MOL.ac -d ATOMTYPE_GFF.DEF ...
Unrecognized atomic name ( 1).
forrtl: No such file or directory
forrtl: severe (29): file not found, unit 10, file /home/aipacino/environment/sobtop_1.0/MOL.ac