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标题: 求助：怎么计算一个分子对水的吸附能 [打印本页]

作者
Author: 木鱼 时间: 2025-5-23 15:41
标题: 求助：怎么计算一个分子对水的吸附能
1、是先优化整体，再把两个组分拿出来优化，最后能量相减吗?
2、我的优化参数设置的合适吗

作者
Author: Dyyyzz 时间: 2025-5-23 16:05
1. 整体思想没错。
2. 光看个结构图看不出参数，起码上传个输入文件。

作者
Author: 木鱼 时间: 2025-5-23 16:37

Dyyyzz 发表于 2025-5-23 16:05
1. 整体思想没错。
2. 光看个结构图看不出参数，起码上传个输入文件。

好的好的，我的输入文件是

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-5-23 16:54
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-5-23 16:55 编辑

木鱼发表于 2025-5-23 16:37
好的好的，我的输入文件是

“上传输入文件”的意思是点那个回形针符号，把文本型的输入文件本身上传为帖子附件（如果尺寸较大需先压缩）。这样截屏放个图片一点也不方便下载来放到文本编辑器或可视化软件查看，总不能要求想帮你的人先费功夫识别图像、一个字一个字地敲键盘做成文件吧

一楼的结构似乎有个苯环上的碳缺少了氢原子，导致自旋多重度变成2了。计算结合能的问题本身看http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html的讲解，这个链接我在你之前问Zn的结合能那帖也贴过，但是没见回应。

作者
Author: 木鱼 时间: 2025-5-23 20:49

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-5-23 16:54
“上传输入文件”的意思是点那个回形针符号，把文本型的输入文件本身上传为帖子附件（如果尺寸较大需先压 ...

好的好的，没有想到可以上传文件，我把文件上传了；
确实是少了个氢原子，谢谢提醒，那个上次发的贴子，当时还看不太懂，不知道怎么提问，现在又看了一遍，大概了解了，谢谢回复；
还有问题想问下，就是我现在算的是气相结合能吗？

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-5-23 22:03

木鱼发表于 2025-5-23 20:49
好的好的，没有想到可以上传文件，我把文件上传了；
确实是少了个氢原子，谢谢提醒，那个上次发的贴子， ...

单从没用隐式溶剂模型而言确实是气相，然而没有振动分析既无法确认是稳定结合也无法得到热力学校正量，泛函和基组得到的单点能也精度不佳，所以这个计算离得到能用的结合能还有点距离。此外水分子不是随意放在有机物旁边就能形成吸附的，需要做构型搜索寻找稳定结合位点，可以在论坛搜搜过往讨论。

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