标题: 求助:服务器跑gromacs出现盒子太小无法进行域分解的问题 [打印本页] 作者Author: 哇酷哇酷 时间: 2025-6-2 23:38 标题: 求助:服务器跑gromacs出现盒子太小无法进行域分解的问题 出现这个错误,我用自己电脑跑就可以(win版),放服务器就不行,我一直调小rank数重跑,但是调到2也不行,只有1才能跑,但是rank数1跑的很慢。请教一下大佬如何解决,下面是我服务器跑的脚本
Fatal error:
There is no domain decomposition for 2 ranks that is compatible with the given
box and a minimum cell size of 9.63553 nm
Change the number of ranks or mdrun option -rdd or -dds
Look in the log file for details on the domain decom[attach]113863[/attach]position