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标题: 原子数一千多，半经验优化一直失败 [打印本页]

作者
Author: qyl 时间: 2025-6-3 16:16
标题: 原子数一千多，半经验优化一直失败
想用半经验简单优化一下，得到mmff94电荷，进而跑动力学模拟，半经验优化一直失败，降低收敛标准仍然失败。

作者
Author: 18217265596 时间: 2025-6-3 18:29
本帖最后由 18217265596 于 2025-6-3 18:30 编辑

这种体系，欢迎拥抱gfnff或者gfn0/1 xtb
算的又快又好
我粗看了一眼你这全是重复单元你为什么不按单元算？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-6-3 18:31
聚合物产生电荷的方法是截取片段（例如往往取3个左右的重复单元）产生电荷，不要拿整个聚合物做结构优化、产生电荷，既浪费机时，结果又未必更准。

作者
Author: qyl 时间: 2025-6-3 20:29

wzkchem5 发表于 2025-6-3 18:31
聚合物产生电荷的方法是截取片段（例如往往取3个左右的重复单元）产生电荷，不要拿整个聚合物做结构优化、 ...

聚合物截取重复单元做优化，仅仅为了得到resp电荷，最后做动力学模拟时，其实只要得到resp电荷，就可以直接做动力学模拟，没必要对分子做优化处理。这样理解对吗？谢谢啦

作者
Author: 18217265596 时间: 2025-6-3 21:42

qyl 发表于 2025-6-3 20:29
聚合物截取重复单元做优化，仅仅为了得到resp电荷，最后做动力学模拟时，其实只要得到resp电荷，就可以直 ...

你用gaff就不用
你要自己拟合参数就要

作者
Author: qyl 时间: 2025-6-3 22:45

18217265596 发表于 2025-6-3 21:42
你用gaff就不用
你要自己拟合参数就要

好的，谢谢啦

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-3 23:05
MMFF94原子电荷只依赖于连接关系，优化结构毫无意义、完全多余

看此文了解不同原子电荷计算的基本原理
一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表！
http://sobereva.com/714（http://bbs.keinsci.com/thread-46067-1-1.html）

作者
Author: qyl 时间: 2025-6-4 09:25

sobereva 发表于 2025-6-3 23:05
MMFF94原子电荷只依赖于连接关系，优化结构毫无意义、完全多余

好的，谢谢老师

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-6-4 20:56

qyl 发表于 2025-6-3 20:29
聚合物截取重复单元做优化，仅仅为了得到resp电荷，最后做动力学模拟时，其实只要得到resp电荷，就可以直 ...

对。我没注意你需要的是MMFF94电荷，那更是连重复单元优化都不需要

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