计算化学公社

标题: Multiwfn绘制RDG等值面求助 [打印本页]

作者
Author: zpk 时间: 2017-3-23 10:54
标题: Multiwfn绘制RDG等值面求助
我想用VMD绘制图中区域的RDG等值面，先用Multiwfn在图中区域绘制散点图，输出函数1和函数2的格点文件，然后用VMD打开，但是那个box范围却不是之前设定的范围，而且RDG等值面只有一小块，不知道是哪里出现了问题。

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-23 11:03
vmd显示的box只是整个体系的box而已，你VMD显式的cube文件显然是已经正确编辑了，否则环中心会出现位阻；VMD显示的确实不如Multiwfn“顺滑”，感觉Multiwfn在显式时似乎会做额外的差值，所以如果要用VMD达到同样的效果可能要算更密的格点

作者
Author: 冰释之川 时间: 2017-3-23 11:23

liyuanhe211 发表于 2017-3-23 11:03
vmd显示的box只是整个体系的box而已，你VMD显式的cube文件显然是已经正确编辑了，否则环中心会出现位阻；VM ...

也有可能是渲染器的问题

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2017-3-23 12:32

冰释之川发表于 2017-3-23 11:23
也有可能是渲染器的问题

(⊙o⊙)? 我做出来一直有楼主的图的感觉

作者
Author: zpk 时间: 2017-3-23 15:50

liyuanhe211 发表于 2017-3-23 11:03
vmd显示的box只是整个体系的box而已，你VMD显式的cube文件显然是已经正确编辑了，否则环中心会出现位阻；VM ...

非常感谢

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-23 16:15
VMD显示有问题，或者文件你没弄对。应当是对应的，比如

(, 下载次数 Times of downloads: 46)
(, 下载次数 Times of downloads: 39)
反正Multiwfn里你直接看到的盒子范围肯定是实际范围

作者
Author: zpk 时间: 2017-3-28 09:06

sobereva 发表于 2017-3-23 16:15
VMD显示有问题，或者文件你没弄对。应当是对应的，比如

老师你好，像这种RDG等值面上下两面的颜色的有差别是什么原因？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-28 09:42

zpk 发表于 2017-3-28 09:06
老师你好，像这种RDG等值面上下两面的颜色的有差别是什么原因？

因为RDG等值面本身有一定厚度，恰好在不同的两个面上sign(lambda2)rho的符号有所不同

作者
Author: zpk 时间: 2017-3-28 11:15

sobereva 发表于 2017-3-28 09:42
因为RDG等值面本身有一定厚度，恰好在不同的两个面上sign(lambda2)rho的符号有所不同

谢谢老师

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