计算化学公社

标题: 如何从trr文件中提取某一组分的速度文件? [打印本页]

作者
Author:
sssyyuan    时间: 2025-6-7 10:15
标题: 如何从trr文件中提取某一组分的速度文件?
想请教一下大佬们,如何从trr文件中提取某一组分的速度信息,如何才能获得某一组分的整体平均速度?并且提取出来后有无相关脚本可以处理数据?
作者
Author:
Dempey    时间: 2025-6-7 10:36
用traj命令-ov可以提取每个原子的速度到xvg文件中,再自己平均一下就行了
  1. gmx traj -s *.tpr -f *.trr -ov vel.xvg
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