计算化学公社

标题: 求助金属Cu2+络合物的计算泛函和基组选择 [打印本页]

作者
Author: Sally-L 时间: 2025-6-9 11:00
标题: 求助金属Cu2+络合物的计算泛函和基组选择
各位老师好，我在计算过渡金属络合物（Cu2+）的络合能（ΔG=Ecomplex−(Emetal+Eligand)）时，需要将金属离子、配体以及金属络合物的吉布斯自由能都计算出来，Cu2+我是用SMD/cam-b3lyp/SDD优化并计算单点能的，配体用SMD/CAM-B3LYP/6-31+G(d)优化，用SMD/CAM-B3LYP/6–311++ G(2d,2p)计算单点能，金属络合物中Cu2+用cam-b3lyp/SDD优化，配体用CAM-B3LYP/6-31+G(d)优化。请问计算络合物单点能的时候需要将Cu2+与配体分开计算吗，还是用同一套基组，怎么选择？

作者
Author: pikachuupup 时间: 2025-6-9 17:37
本帖最后由 pikachuupup 于 2025-6-10 16:14 编辑

感觉你说的有点混乱，首先络合物在SMD/CAM-B3LYP/6-31+G(d),SDD水平上优化，然后在SMD/CAM-B3LYP/6–311++ G(2d,2p),SDD水平上单点后求出G，这就是你说的Ecomplex；

再然后配体SMD/CAM-B3LYP/6-31+G(d)优化，SMD/CAM-B3LYP/6–311++ G(2d,2p)单点求出G，这就是你说的Eligand；

金属Cu2+直接SMD/CAM-B3LYP/SDD水平上freq得到G，就是你说的Emetal。

直接def2-TZVP得了呗

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-9 18:27
没事甭用CAM-B3LYP，根本不是干这种事的。Gaussian用户改成PBE0-D3(BJ)。仔细看下文
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272（http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html）

光靠隐式溶剂模型没法描述好单原子离子，下文说了
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327（http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html）

没事甭乱加弥散，仔细看
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119
配体部分优化远不如用6-311G*或def-TZVP，单点远不如用def2-TZVPP

另外，对于单原子来说，没有“优化”一说

作者
Author: Sally-L 时间: 2025-6-9 22:11

sobereva 发表于 2025-6-9 18:27
没事甭用CAM-B3LYP，根本不是干这种事的。Gaussian用户改成PBE0-D3(BJ)。仔细看下文
简谈量子化学计算中DF ...

非常感谢老师，还有几个问题想请教老师
1.您的意思是说在计算络合物单点能的时候，配体部分和金属分别用不同的基组计算是吗和优化的时候一样，不知道有没有理解对？
2.这个络合物中只有一个铜离子，如果不用赝势基组是不是也可以？
3.选用的基组和泛函在文章中需要讲清楚选择原因吗，不知道要从哪方面怎么讲，可以请老师指点一下吗？

作者
Author: Sally-L 时间: 2025-6-9 22:13

pikachuupup 发表于 2025-6-9 17:37
感觉你说的有点混乱，首先络合物在SMD/CAM-B3LYP/6-31+G(d),SDD水平上优化，然后在SMD/CAM-B3LYP/6–311++ ...

def2-TZVP这个赝势基组可以用来算配体吗？我不太了解

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-9 23:48

Sally-L 发表于 2025-6-9 22:11
非常感谢老师，还有几个问题想请教老师
1.您的意思是说在计算络合物单点能的时候，配体部分和金属分别用 ...

1 语义不明
2 是
3 如果用的是算此类体系常用的，不解释可以。如果用小众向的计算级别，最好解释，否则大概率审稿人也会问

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-9 23:48

Sally-L 发表于 2025-6-9 22:13
def2-TZVP这个赝势基组可以用来算配体吗？我不太了解

明明这对前四周期是全电子基组
认真看我的博文
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373（http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html）

作者
Author: Sally-L 时间: 2025-6-10 09:30

sobereva 发表于 2025-6-9 23:48
1 语义不明
2 是
3 如果用的是算此类体系常用的，不解释可以。如果用小众向的计算级别，最好解释，否则 ...

好的谢谢老师，
1是想说计算络合物单点能的时候配体部分和金属部分都是统一泛函和基组

作者
Author: Sally-L 时间: 2025-6-10 09:30

sobereva 发表于 2025-6-9 23:48
明明这对前四周期是全电子基组
认真看我的博文
谈谈赝势基组的选用

明白了感谢老师

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)