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标题: 求助：磷脂层附近出现离子聚集现象 [打印本页]

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Author: MGRACE 时间: 2025-6-10 18:09
标题: 求助：磷脂层附近出现离子聚集现象
本帖最后由 MGRACE 于 2025-6-10 18:14 编辑

老师们好，目前在模拟POPG和POPE构成的细胞膜处在0.6mol/L的NaCl的水溶液中的行为，离子使用amber14sb中的离子参数，水使用TIP3P，脂质力场使用lipid17。但在模拟20ns后出现离子聚集现象，有什么推荐的解决方案吗？gro文件太大无法上传

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-10 23:00
AMBER自带的离子参数在浓度较高时会结晶，之前论坛里我说过多次
改用更好的离子参数，比如KBFF、Madrid-2019的

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