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标题: 两个共轭自由基如何形成“二”形的二聚体？ [打印本页]

作者
Author: 18392667184 时间: 2025-6-11 11:18
标题: 两个共轭自由基如何形成“二”形的二聚体？
本帖最后由 18392667184 于 2025-6-11 15:20 编辑

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如图所示，想要获得相同的两个共轭自由基的堆叠不成键的结构应该如何获得，图中左边的结构。我试过将两个环戊二烯自由基的结构(五元环)，采用gaussian优化，会形成“匚”字形。采用sob老师的构象搜索，也会形成“匚”字形的机构。那么两个共轭自由基会形成“二”字形的二聚体结构吗？如果会形成，应该如何获得这样的结构呢？

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-6-11 12:28
这张图是从哪篇文献里来的，对phenalenyl以及对环戊二烯基的计算级别如何？一个共轭/芳香自由基能否存在“仅pi-pi堆积而不成共价键的平行二聚体”这点应该看具体结构分析，对于尺寸很小且没有芳香性的环戊二烯自由基而言感觉偶联很合理。此外两个单自由基自旋平行、整体呈三重态的体系显然也比两个单自由基自旋相反、整体呈自旋极化单重态的体系要难偶联，所以有没有提供对称破缺初猜这种细节也是很关键的。别在汉字里塞奇怪的某度问答连接啊喂

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-6-11 12:29
在三重态下做构象搜索，肯定能得到这样结构的二聚体。然后改为开壳层单重态优化，看是否能保持不成C-C键

作者
Author: zjxitcc 时间: 2025-6-11 14:32
你是否在计算过程中正确考虑了开壳层单重态的可能性、是否检验并确保了波函数是稳定的？

作者
Author: 18392667184 时间: 2025-6-11 15:17

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-6-11 12:28
这张图是从哪篇文献里来的，对phenalenyl以及对环戊二烯基的计算级别如何？一个共轭/芳香自由基能否存在“ ...

文献来自https://doi.org/10.1016/j.fuel.2020.118491。如果是这种大尺寸，带芳香性的呢，结构如图。实则我想获得如此结构的二聚体(不成键)应该怎么做，直接进行两个自由基的结构优化，该如何摆放呢？
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作者
Author: 18392667184 时间: 2025-6-11 15:18

wzkchem5 发表于 2025-6-11 12:29
在三重态下做构象搜索，肯定能得到这样结构的二聚体。然后改为开壳层单重态优化，看是否能保持不成C-C键

好的，谢谢王老师，我试试。

作者
Author: 18392667184 时间: 2025-6-11 15:19

zjxitcc 发表于 2025-6-11 14:32
你是否在计算过程中正确考虑了开壳层单重态的可能性、是否检验并确保了波函数是稳定的？

没有，结构优化我不知道怎么摆放，就是大概摆放算了一下，算出来是偶联的。

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