计算化学公社

标题: 多个科学计算软件是否会存在冲突 [打印本页]

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Author: xcgotk 时间: 2025-6-16 22:08
标题: 多个科学计算软件是否会存在冲突
本帖最后由 xcgotk 于 2025-7-13 09:52 编辑

本人课题组使用社长贴中推荐过的配置，AMDEPYC7R32*2
因为多人使用，涉猎不深但是比较杂，因此各种软件都可能用到，目前在用/可能用到的有gaussian、vasp、gromacs、lammps，Multiwfn、qvasp
使用ssh工具内网连接控制，使用的是ubuntu20.4
想问的问题有
多个软件的配置是否会冲突
如果有冲突要怎样解决（比如安装虚拟机，建立不同的软件专用）
如果在主机上添加多个用户，开机之后是可以同时连接多个用户吗（不同用户能否同时运行）

感谢大家的回复，当前的方案是将VASP和CP2K分别放在了两个用户中，因为是新手维护，所以比较乱，后续可能考虑重新安装整个系统

作者
Author: wal 时间: 2025-6-16 22:18
本帖最后由 wal 于 2025-6-16 22:19 编辑

你想说的应该是ssh 不是shh

Multiwfn和Gaussian这种静态预编译的应该不太会有冲突，别的我不咋用不清楚，要冲突估计就是gcc版本，mpi版本之类的有可能冲突
避免冲突最简单的办法，每个软件都写好env.sh，用哪个source哪个，用完了刷新环境变量，进阶玩法可以用module之类的
可以同时连接多个用户不会挤掉的

作者
Author: xcgotk 时间: 2025-6-16 22:40

wal 发表于 2025-6-16 22:18
你想说的应该是ssh 不是shh

Multiwfn和Gaussian这种静态预编译的应该不太会有冲突，别的我不咋用不清楚 ...

ssh已修改，谢谢您的回复

作者
Author: pikachuupup 时间: 2025-6-17 09:15
本帖最后由 pikachuupup 于 2025-6-17 09:18 编辑

据我所知vasp和orca会因为mpi冲突，一般就是用脚本分别调用，要不就是多开账户

作者
Author: Daniel_Arndt 时间: 2025-6-17 10:13
建议你装Lmod进行管理。

Lmod的配置文件写起来比Environment Modules容易多了，而且没有Environment Modules那么多历史包袱。如果是新的集群的话，建议考虑Lmod。我印象中Lmod是可以读取Environment Modules配置文件的，如果你之前写过Environment Modules配置文件的话，应该可以简单修改后供Lmod使用。

作者
Author: llity 时间: 2025-6-20 15:23

wal 发表于 2025-6-16 22:18
你想说的应该是ssh 不是shh

Multiwfn和Gaussian这种静态预编译的应该不太会有冲突，别的我不咋用不清楚 ...

我安装slurm mpi软件在Ubuntu上怎么安装哦，总是版本不对。

作者
Author: reid 时间: 2025-7-12 21:30
会冲突，但是要活学活用好bashrc。我的服务器上安装了G16，orca，gromacs，cp2k，multiwfn，vasp等。其中，vasp会与orca及cp2k有冲突

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