计算化学公社

标题: Metadynamics计算自由能时偏置势与配位数CV的关系如何理解 [打印本页]

作者
Author: JCenter 时间: 2025-6-17 17:35
标题: Metadynamics计算自由能时偏置势与配位数CV的关系如何理解
我们在使用metadynamics计算过程的自由能时，一般会设置CVs，常用的有距离和配位数。对于配位数而言，如果计算的是中心原子A外B原子的配位数，那么产生的metddynLog文件中配位数的数值很容易理解，即A和B原子之间的配位数。如果是A原子外配位多个原子（B、C、D......），是按方程作加和得到的配位数。在添加偏置势时，如何理解呢，偏置势是平均作用在A与每个配位原子上的距离r上，最终使加和配位数变化；还是偏置势根据系统的运动，仅对最可能进行配位的原子比如B，,即对A和B之间的距离r进行作用，最终使配位数数值变化呢

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)