计算化学公社

标题: Gaussian09对一个200原子的体系进行限制性优化出现中断 [打印本页]

作者
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pingsenshi    时间: 2025-6-18 20:05
标题: Gaussian09对一个200原子的体系进行限制性优化出现中断
各位老师,我在Gaussian09B.01的版本中想对一个200原子的体系(包含Pd,Cu,I,C,P,H)进行限制性优化(几何优化),所用到的泛函和基组分别是B3LYP,基组轻原子用6-31G*,Pd,Cu,I用SDD,因为从EXAFS的证据来看其键长为2.8埃左右,所以我在限制性优化设置中将Pd与I设为-1固定住并使其键长为2.8埃,结果放到G09进去算的时候发现到第六次就莫名的中断了,不知道是什么原因,我附上gjf与log报告,请教一下各位老师具体是什么原因,以及我这么处理是否正确


%chk=component13_CCPh.chk
%mem=85GB
%nprocshared=45
# opt=cartesian B3LYP/genecp iop(3/174=1000000,3/175=2238200,3/177=452900,3/178=4655000)

Title Card Require

0 1
Pd              -1   10.17138874   10.15604101    8.82536264
P                0    9.52515876    8.15907148    9.86478243
P                0   10.38774297   11.98262984    7.37538528
C                0   10.82871739    7.05473150   10.53040024
C                0    9.56100883   13.59061220    7.70892558
C                0   12.00155329    7.61607298   11.05733123
...
I               -1   11.20700213   11.37372962   11.11922318

C H P 0
6-31G*
****
Cu Pd I 0
SDD
****

Cu Pd I 0
SDD



作者
Author:
sobereva    时间: 2025-6-19 06:22
基于最后一帧结构,继续优化

写一堆IOp完全意义不明

当前体系分子内弱相互作用那么明显,B3LYP不带色散校正根本不行,仔细看
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的
http://sobereva.com/557http://bbs.keinsci.com/thread-17899-1-1.html
强烈建议用>=G09 D.01版,带上D3校正。倘若实在只能用当前版本,用wB97XD也强得多

不建议写=cartesian,明显导致收敛更困难

对I强烈不建议用SDD,都没带d极化函数。至少要用def2-SVP,更好点用lanl08(d),仔细看下文
谈谈赝势基组的选用
http://sobereva.com/373http://bbs.keinsci.com/thread-5625-1-1.html


计算这么大体系,强烈建议带上#P便于监控

作者
Author:
pingsenshi    时间: 2025-6-19 16:56
sobereva 发表于 2025-6-19 06:22
基于最后一帧结构,继续优化

写一堆IOp完全意义不明

十分感谢sob老师,写IOp是因为D3校正在B0.1版本里用不了,所用写了IOp去弥补没有D3校正的效果,但似乎两者并无关系
作者
Author:
sobereva    时间: 2025-6-19 17:21
pingsenshi 发表于 2025-6-19 16:56
十分感谢sob老师,写IOp是因为D3校正在B0.1版本里用不了,所用写了IOp去弥补没有D3校正的效果,但似乎两 ...

写IOp是指定D3参数的,你的版本根本不支持D3,指定参数毫无意义
作者
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wzkchem5    时间: 2025-6-19 18:48
pingsenshi 发表于 2025-6-19 16:56
十分感谢sob老师,写IOp是因为D3校正在B0.1版本里用不了,所用写了IOp去弥补没有D3校正的效果,但似乎两 ...

如果没买更高版本的高斯,建议改用ORCA。
B3LYP不加色散校正,又是算这么大体系,结果根本没法用。我前段时间刚毙掉一篇没加色散校正的文章
作者
Author:
pingsenshi    时间: 2025-6-19 20:23
sobereva 发表于 2025-6-19 17:21
写IOp是指定D3参数的,你的版本根本不支持D3,指定参数毫无意义

明白了 再次感谢sob老师~
作者
Author:
pingsenshi    时间: 2025-6-19 20:25
wzkchem5 发表于 2025-6-19 18:48
如果没买更高版本的高斯,建议改用ORCA。
B3LYP不加色散校正,又是算这么大体系,结果根本没法用。我前 ...

感谢提醒~已经下午连夜换上D0.1的版本了,之前还以为设置了IOp就是进行了D3校正,结果发现算出来的模型与ORCA的结果差距十分大,还以为是不同软件问题,现在经过指点的话才知道原来是没有加上色散校正导致的




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