标题: packmol空间限制求助,想生成填充oleicacid分子的盒子,其中DOPC球形胶束处于内部 [打印本页] 作者Author: csm 时间: 2025-6-18 20:05 标题: packmol空间限制求助,想生成填充oleicacid分子的盒子,其中DOPC球形胶束处于内部 我想用packmol程序生成一个填充oleicacid分子的盒子,其中DOPC球形胶束处于内部,以上是我的inp文件,但却一直显示
ERROR: Packmol was unable to put the molecules
in the desired regions even without
considering distance tolerances.
Probably there is something wrong with
the constraints, since it seems that
the molecules cannot satisfy them at
at all.
这个错误提示,请问各位老师可以帮我看一下我的inp文件到底哪里设置不合理吗,我实在是找不到问题在哪了 作者Author: Arkd 时间: 2025-11-18 01:02
我也遇到了,请问解决了吗 作者Author: SharkYYX2025 时间: 2026-2-17 21:32 本帖最后由 SharkYYX2025 于 2026-2-17 21:37 编辑
@Arkd
你的DOPC看起来特别大,所以设置的30A不够,就报错了。可以在VMD里头拿比例尺看看,或者就单纯看看pdb里头坐标最大值最小值。我改了40A就可以了 (, 下载次数 Times of downloads: 5)