计算化学公社

标题: 关于文章中苯环形成过程中过渡态的虚频问题 [打印本页]

作者
Author: cym 时间: 2025-6-19 09:19
标题: 关于文章中苯环形成过程中过渡态的虚频问题
http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract30064.shtml
通过价层电子密度分析展现分子电子结构 (pku.edu.cn)

求教：上述链接文章中Figure 8 中苯环形成过程中过渡态的虚频问题，过渡态不是只有一个虚频吗？图里的C1-C5和C4-C6之间是不是会形成两个虚频呀？

作者
Author: pal 时间: 2025-6-19 09:35
不明白为什么会产生两个虚频，这不就对应于一种振动模式

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-6-19 10:16
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-6-19 10:25 编辑

无论是实频还是虚频，一个简正振动模式可以涉及很多个键长键角二面角的变化，即由很多内坐标的耦合运动产生。过渡态的确有且只有一个总体的振动虚频，但并未限定只有单一内坐标做主要贡献。参考下述博文
Gaussian中分析振动模式成份的关键词freq=intmodes
http://sobereva.com/106

这种常规的Diels-Alder反应形成的不是苯环而是环己烯，能形成苯环（或者更确切地说是苯炔）的那种叫Hexadehydro Diels-Alder反应。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-19 14:37
同一个问题别在论坛里两处问，刚在http://bbs.keinsci.com/thread-6869-1-1.html里回完你的问题

作者
Author: cym 时间: 2025-6-19 15:10

sobereva 发表于 2025-6-19 14:37
同一个问题别在论坛里两处问，刚在http://bbs.keinsci.com/thread-6869-1-1.html里回完你的问题

谢谢卢老师提醒，下次我一定注意

作者
Author: cym 时间: 2025-6-20 16:53

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-6-19 10:16
无论是实频还是虚频，一个简正振动模式可以涉及很多个键长键角二面角的变化，即由很多内坐标的耦合运动产生 ...

您好，我看了您分享的博文。但是Figute8的这种过渡态怎么搜索呢？自己尝试了计算算不出来。麻烦您指点一下

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-6-20 17:09
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-6-20 17:11 编辑

cym 发表于 2025-6-20 16:53
您好，我看了您分享的博文。但是Figute8的这种过渡态怎么搜索呢？自己尝试了计算算不出来。麻烦您指点一 ...

这是另一个问题了。找过渡态一般需要凭化学直觉摆个初猜来优化，比如这里Diels-Alder反应可以尝试先优化单分子产物环己烯的船式构象，再把对应于乙烯与丁二烯的两个片段距离拉开，即增长两个碳碳键，作为初始结构。要是缺乏这种化学直觉，就去找那些涉及反应势垒的benchmark文章，看看数据集里过渡态结构一般都长什么样，比如当前这个最简单的Diels-Alder反应就在GMTKN55的周环反应子集里有。

单说“自己尝试了计算算不出来”没办法有针对性地回答，得详细描述尝试的过程、提供相关文件。

作者
Author: cym 时间: 2025-6-20 17:25

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-6-20 17:09
这是另一个问题了。找过渡态一般需要凭化学直觉摆个初猜来优化，比如这里Diels-Alder反应可以尝试先优化 ...

好的，我再学习一下。感谢您的回复

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