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标题: 求助,不同温度下,隐式溶剂模型,A+B=C,用shermo矫正如何算吉普斯自由能变化? [打印本页]

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lzhxjs    时间: 2025-6-19 11:46
标题: 求助,不同温度下,隐式溶剂模型,A+B=C,用shermo矫正如何算吉普斯自由能变化?
求助,要测110度下隐式溶剂模型下A+B=C的自由能变化和能量变化,步骤为:
(1)关键词是B3LYP/6-311G(d,p) em=GD3BJ opt freq scrf(SMD,solvent=ethanol),对乙醇环境的情况下用B3LYP-D3(BJ)/6-311G*对各物质进行优化和振动分析。
(2)关键词是B2PLYPD3/def2TZVP geom=allcheck,找出各物质(1)的结构真空下较高精度电子能量HF2
(3)关键词是M052X/6-31G* geom=allcheck,算各物质(1)的结构M05-2X/6-31G*在真空下的电子能量HF3
(4)关键词是M052X/6-31G* scrf(SMD,solvent=ethanol) geom=allcheck,用(1)的结构在M05-2X/6-31G*,SMD溶剂模型下计算各物质电子能量HF4
数据处理如下:
a.   在sherom setting in中设置各物质E=HF2值,T=383.15k,sclZPE= 0.9888(6-311G**下查出的),将(1)中out文件拖进来,查看各物质U1/E1/G1校正后的值;
b.   在sherom setting in中设置各物质E=HF3值,T=383.15k,sclZPE= 0.9888,将(1)中out文件拖进来,查看各物质U3/E3/G3校正值;   
c.   在sherom setting in中设置各物质E=HF4值,T=383.15k,sclZPE= 0.9888,将(1)中out文件拖进来,查看各物质U4/E4/G4校正值;  
d. 110摄氏度下 各物质的溶解自由能=G4-G3, 那么各物质在乙醇中的自由能G=G2+G4-G3+1.89/627.51,结合能=G(AB)-G(A)-G(B)
问题一,请问d算法对吗?还是因为之前老师发帖说的不同温度下的溶解自由能不能算,所以b.c不需要矫正,溶解自由能=H4-H3,那么各物质在乙醇中的自由能G=G2+H4-H3+1.89/627.51,,结合能=G(AB)-G(A)-G(B);
问题二,如果算不同温度下能量U,数据统计又该用哪个量?


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wzkchem5    时间: 2025-6-19 12:27
一般的隐式溶剂模型虽然不能算非298K下的溶解自由能,但是也不能不算溶解自由能,如果没有别的更好的办法的话,至少应该用298K下的溶解自由能近似你要的温度下的溶解自由能,而不是完全忽略溶解自由能
作者
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lzhxjs    时间: 2025-6-19 13:08
wzkchem5 发表于 2025-6-19 12:27
一般的隐式溶剂模型虽然不能算非298K下的溶解自由能,但是也不能不算溶解自由能,如果没有别的更好的办法的 ...

谢谢老师,也就是用G=G2(T)+H4-H3+1.89/627.51来算是吧?
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wzkchem5    时间: 2025-6-19 13:54
lzhxjs 发表于 2025-6-19 13:08
谢谢老师,也就是用G=G2(T)+H4-H3+1.89/627.51来算是吧?

你没有定义G2是什么,也没有定义G2(T)
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lzhxjs    时间: 2025-6-19 23:22
wzkchem5 发表于 2025-6-19 13:54
你没有定义G2是什么,也没有定义G2(T)

老师,实在不好意思,打错了,上述帖子中的G2都应改为G1。我的问题是某温度T下的A物质的吉普斯自由能G(A,T)=G1(T温度下经过shermo矫正HF1后得到的G值)+H4-H3,这样算对不对?
作者
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wzkchem5    时间: 2025-6-20 12:33
lzhxjs 发表于 2025-6-19 23:22
老师,实在不好意思,打错了,上述帖子中的G2都应改为G1。我的问题是某温度T下的A物质的吉普斯自由能G(A, ...

对。这样算出来的虽然未必准,但比不考虑H4-H3准很多
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lzhxjs    时间: 2025-6-20 15:55
wzkchem5 发表于 2025-6-20 12:33
对。这样算出来的虽然未必准,但比不考虑H4-H3准很多

感谢老师的答疑,解决了许久的困惑




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