计算化学公社

标题: ZSM-5上的C6小分子脱氢体系，CP2K振动分析虚频问题 [打印本页]

作者
Author: Wednesday 时间: 2025-6-20 08:19
标题: ZSM-5上的C6小分子脱氢体系，CP2K振动分析虚频问题
求助，做的ZSM-5上的C6小分子脱氢体系，跑完CI-NEB后用一致的参数对过渡态进行振动分析，第一个大虚频的振动方向是想要的，也合理，但是有许多的小虚频，都和催化剂骨架振动相关，推测冻结骨架后虚频就只剩一个了，这样做合理么？应该全弛豫还是冻结骨架呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-22 07:25
如果研究的问题和骨架没什么关系可以这样。本身算吸附问题冻结骨架就是常见策略，且主要不是为了避免骨架的虚频，而是为了极大地节约振动分析的时间

作者
Author: Wednesday 时间: 2025-6-22 09:20

sobereva 发表于 2025-6-22 07:25
如果研究的问题和骨架没什么关系可以这样。本身算吸附问题冻结骨架就是常见策略，且主要不是为了避免骨架的 ...

感谢sob老师

作者
Author: youyno 时间: 2025-6-22 17:12
分子筛催化反应的振动分析一般都采用PHVA也就是频率计算时只考虑Al周围与B酸关联的几个原子和客体分子的频率，其他原子均冻结，这样可以减小不相关区域频率计算的误差引起整个体系在热力学计算时的不准确。但是结构优化时还是需要全部弛豫保证计算能量的结构的可靠性。

作者
Author: Wednesday 时间: 2025-6-22 18:15

youyno 发表于 2025-6-22 17:12
分子筛催化反应的振动分析一般都采用PHVA也就是频率计算时只考虑Al周围与B酸关联的几个原子和客体分子的频 ...

谢谢老师

作者
Author: MVK 时间: 2025-12-16 22:13

sobereva 发表于 2025-6-22 07:25
如果研究的问题和骨架没什么关系可以这样。本身算吸附问题冻结骨架就是常见策略，且主要不是为了避免骨架的 ...

sob老师请问我看到cp2k做振动分析时需要用调整到更严收敛限的几何优化结构来做但是我目前一大批底物和过渡态都是用默认收敛限优化出来的如果用默认收敛限的几何优化以及过渡态结构再针对沸石冻结做振动分析然后结合shermo计算得到的自由能来得到台阶图可以接受吗?而且我们之前做量子化学计算自由能习惯上是通过几何优化级别的自由能矫正能加上高精度单点的电子能量计算不知道cp2k算周期性体系可不可以这样做?

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-17 03:57

MVK 发表于 2025-12-16 22:13
sob老师请问我看到cp2k做振动分析时需要用调整到更严收敛限的几何优化结构来做但是我目前一大批底物和 ...

为了得到更好结果，CP2K算电子能量时也建议用更好级别，比如换成更大基组、更好的泛函等。这点和量子化学计算一样
优化用默认的收敛限一般问题不大，但对于势能面很柔的体系可能不够准或容易出虚频

作者
Author: MVK 时间: 2025-12-19 13:27

sobereva 发表于 2025-12-17 03:57
为了得到更好结果，CP2K算电子能量时也建议用更好级别，比如换成更大基组、更好的泛函等。这点和量子化学 ...

老师这样做计算振动分析后出现了非常多虚频结果是不是不可以用必须要继续优化了

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-24 05:20

MVK 发表于 2025-12-19 13:27
老师这样做计算振动分析后出现了非常多虚频结果是不是不可以用必须要继续优化了

看具体情况，虚频未必是几何优化不准所致，也可能CUTOFF不够高、EPS_SCF不够低等因素导致

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