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标题: 求助：关于模拟液体时决定浓度的体积 [打印本页]

作者
Author: oillio 时间: 2025-6-21 14:59
标题: 求助：关于模拟液体时决定浓度的体积
老师好，我有一个疑问。在gromacs中模拟溶液，这个决定溶液浓度的体积是模拟盒子的体积？还是由放置的液体分子数目推算出来的溶液的体积？感谢老师解答。

作者
Author: pal 时间: 2025-6-21 15:31
不一定是模拟盒子的体积，比如说nvt研究的包括液相和气相，都是液相就是模拟盒子的体积。“由放置的液体分子数目推算出来的溶液的体积”那得知道密度是多少，密度跟力场参数相关

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-22 08:19
由液相占据的体积来决定。注意往往这个体积本身有一定任意性，比如气液界面的分界不是精确一刀切的

作者
Author: oillio 时间: 2025-8-26 14:17

sobereva 发表于 2025-6-22 08:19
由液相占据的体积来决定。注意往往这个体积本身有一定任意性，比如气液界面的分界不是精确一刀切的

老师，如果不涉及气液界面只是单纯的溶液体系，可不可以认为最终产生相gro文件中的盒子体积就是液相占据的体积？

作者
Author: sobereva 时间: 2025-8-27 08:03

oillio 发表于 2025-8-26 14:17
老师，如果不涉及气液界面只是单纯的溶液体系，可不可以认为最终产生相gro文件中的盒子体积就是液相占据 ...

可以

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