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标题: 布洛芬分子的范德华势分析求助 [打印本页]

作者
Author: 轻舟~ 时间: 2025-6-21 17:19
标题: 布洛芬分子的范德华势分析求助
就是我想问一下，我参照http://sobereva.com/551绘制了一个布洛芬分子的范德华彩色填充平面图，由于我研究的只是一个分子，没有像sob老师举的例子那样的对称性，于是我就把我的图先设置为x,y平面，然后z为0.1a。后面的设置和老师举的例子差不多，然后Multiwfn就生成了这张图。我发现这个分子体系中只要跟原子距离很近的地方，就都是范德华势正值很大的地方，在分子的“沟壑区域”，才会出现范德华势为负的地方。这种特点的图能不能结合我早前画出来的范德华势等值面图来一起解释这个分子的一些性质啊，范德华势等值面图我也画出来了，见第二个图。还有一个地方就是我不太会解释这两张图，有没有大佬可以帮忙解释一下，初次尝试使用范德华势，有点困惑。

还有绘制那个彩色等值面图的步骤我也贴上来了：
4/绘制平面图
25/范德华势
1/彩色填充图
空格/默认格点
1/xy平面
0.1/z=0.1
4/显示原子标签
2/用绿色
17  //修改显示标签
20  //20 Bohr。
n
8  /显示化学键
12/用深绿色
2  //显示等值线
3  //修改等值线
14  //修改负值的等值线风格
20,20  //虚线的长度和间隔
5  //线粗值（比默认的更粗）
1  //保存等值线设置并返回
19  //修改色彩变化方式
8  //蓝-白-红
选-1重新绘制图像

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-22 07:46
当前体系严重不适合绘制平面图。直接用等值面图讨论就完了。我的范德华势的原文里、Multiwfn 2024年JCP原文里（J. Chem. Phys., 161, 082503 (2024) DOI: 10.1063/5.0216272）、下文里都有讨论例子，举一反三
8字形双环分子对18碳环的独特吸附行为的量子化学、波函数分析与分子动力学研究
http://sobereva.com/674（http://bbs.keinsci.com/thread-38312-1-1.html）

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