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标题: molclus调用gaussian时无法得到结果 [打印本页]

作者
Author: HZ1314520 时间: 2025-6-25 10:00
标题: molclus调用gaussian时无法得到结果
本帖最后由 HZ1314520 于 2025-6-26 20:40 编辑

各位老师：
大家好，我在使用molclus+gaussian练习多巴胺构象优化结构的过程中，使用gaussian做单点能计算这一步，无法得到结果是怎么回事呢。 (, 下载次数 Times of downloads: 29) (, 下载次数 Times of downloads: 29) (, 下载次数 Times of downloads: 28) (, 下载次数 Times of downloads: 28)
(, 下载次数 Times of downloads: 27)

作者
Author: pal 时间: 2025-6-25 11:16
看屏幕里面的提示，每一个结构计算的时候都有Error：single point calculation did not normally terminated，应该是单点能计算的文件有问题

作者
Author: HZ1314520 时间: 2025-6-25 13:37

pal 发表于 2025-6-25 11:16
看屏幕里面的提示，每一个结构计算的时候都有Error：single point calculation did not normally terminate ...

你好，是template设置指令的问题吗。

作者
Author: pal 时间: 2025-6-25 15:02

HZ1314520 发表于 2025-6-25 13:37
你好，是template设置指令的问题吗。

试试直接手动把坐标放进去gjf跑单点能看看是什么错误

作者
Author: HZ1314520 时间: 2025-6-25 20:27

pal 发表于 2025-6-25 15:02
试试直接手动把坐标放进去gjf跑单点能看看是什么错误

不行啊，还是一样的错误。还是默认了traj里的文件。

作者
Author: pal 时间: 2025-6-25 21:24

HZ1314520 发表于 2025-6-25 20:27
不行啊，还是一样的错误。还是默认了traj里的文件。

我是说把手动把坐标放进gjf的模版，单开一个高斯的任务跑单点能，看看输出是什么问题

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-26 02:13
认真看下文，明确说了要自己看Gaussian产生的out文件内容判断出错原因
Molclus FAQ
http://sobereva.com/730（http://bbs.keinsci.com/thread-50349-1-1.html）

作者
Author: HZ1314520 时间: 2025-6-26 20:42

pal 发表于 2025-6-25 21:24
我是说把手动把坐标放进gjf的模版，单开一个高斯的任务跑单点能，看看输出是什么问题

单跑是没有问题的。使用molclus出现上面out文件中错误是什么原因呢？

作者
Author: HZ1314520 时间: 2025-6-26 23:18

sobereva 发表于 2025-6-26 02:13
认真看下文，明确说了要自己看Gaussian产生的out文件内容判断出错原因
Molclus FAQ
http://sobereva.com/ ...

# M062X/TZVP
------------
1/38=1/1;
2/12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=19,7=101,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-55/1,2,3;
4//1;
5/5=2,38=5/2;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
99/5=1,9=1/99;
-------------
Template file
-------------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  0 Multiplicity = 1

Input Error Input Error Input Error Input Error Input Error Input Error

There are no atoms in this input structure !

Please fix the molecule specification section of your input and try again.

Input Error Input Error Input Error Input Error Input Error Input Error

Error termination via Lnk1e in D:\study\G09W\l101.exe at Thu Jun 26 23:15:14 2025.
Job cpu time:    0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    5 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1

sob老师出现这种错误是什么原因导致的呢，实在搞不明白了。

作者
Author: sobereva 时间: 2025-6-27 06:21

HZ1314520 发表于 2025-6-26 23:18
# M062X/TZVP
------------
1/38=1/1;

template.gjf内容不当或者traj.xyz有问题，导致molclus产生的Gaussian输入文件里没有原子坐标。先认真把molclus相关教程里的例子重复一遍，文件都给全了

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