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标题: 关于离子液体CL&P力场生成的一些问题 [打印本页]

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Author: 方方方 时间: 2025-6-26 17:03
标题: 关于离子液体CL&P力场生成的一些问题
本人在生成CL&P力场的时候，分别使用CL&P力场开发者Agilio Padua编写的fftool工具和autoff工具生成离子液体的力场文件，在观察生成的拓扑文件后，发现存在以下的不同
1.[bonds]项中对于所有的C-H键，fftool工具仅使用约束，而autoff工具则是采用-CH的键伸缩常数
2.[dihedrals]项中，fftool工具还对咪唑环上的二面角进行了定义，autoff中则没有此项，而是将这部分转到了improper项中

2 5 1 6 5 0.00000 8.36800 0.00000 0.00000
1 3 2 7 5 0.00000 9.20480 0.00000 0.00000
2 4 3 8 5 0.00000 8.36800 0.00000 0.00000
3 5 4 9 5 0.00000 9.20480 0.00000 0.00000
1 4 5 10 5 0.00000 9.20480 0.00000 0.00000

复制代码

请问各位，这部分的区别是否在实际模拟中可以忽略？

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