计算化学公社

标题: 求助lobster计算COHP，对于周期性体系边界原子的识别 [打印本页]

作者
Author: xilemiki 时间: 2025-6-30 09:31
标题: 求助lobster计算COHP，对于周期性体系边界原子的识别
Lobster计算CeO2表面Ce和O之间的ICOHP值，导出的CONTCAR中Ce42和O138相连，但是ICOHPLIST.lobster文件中确显示这个两个原子距离较远，请问各位老师出现这个现象的原因和解决方法是什么？

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Author: Up1996 时间: 2025-7-9 10:20
同问！请问博主解决了吗

作者
Author: xilemiki 时间: 2025-7-9 20:09

Up1996 发表于 2025-7-9 10:20
同问！请问博主解决了吗

没有haha,如果你解决了的话捞捞我

作者
Author: Up1996 时间: 2025-7-16 09:26

xilemiki 发表于 2025-7-9 20:09
没有haha,如果你解决了的话捞捞我

我的解决方法就是换个一样的原子，其他原子对可以用

作者
Author: orangesea 时间: 2025-7-16 11:06
本帖最后由 orangesea 于 2025-7-16 11:08 编辑

这个软件的默认设置好像不能考虑周期性，在盒子两侧的原子是按盒子内的距离算的，你这两个原子可能刚好判断位于盒子两侧，有没有大佬解答一下如何考虑周期性

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