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标题: 请问一下各位老师在用Gaussian使用赝势基组结构优化出现了以下input的error [打印本页]

作者
Author: hphz 时间: 2025-7-2 18:04
标题: 请问一下各位老师在用Gaussian使用赝势基组结构优化出现了以下input的error
是报错的信息
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因为我有Ag，所以用了genecp混合基组，如何给Ag了LANL2DZ的赝势基组如下
%nprocshared=20
%mem=64GB
%chk=E:\AAAXmubiomaterialwork\MD\DNAAgNCs.chk
# opt freq b3lyp/genecp scrf=(pcm,solvent=water)

Title Card Required

0 2
坐标

C H N O P 0
6-31G(d)
****
Ag 0
LANL2DZ
****

Ag 0
LANL2DZ

然后就有问题，还有一个事情是，因为我是pdb文件导入的，原子数很多我就没有删掉pdbname那一栏，我也不知道有没有问题，附件是
请各位老师指教，谢谢！
(, 下载次数 Times of downloads: 6)

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-7-2 18:27
比当前报错更加基本的问题在于，这1177个原子的体系基本做不动DFT级别下的几何优化振动分析，更何况只给Windows版Gaussian分配了20核64 GB内存。而且也不知道几个散乱的银原子放在DNA旁边的结构是怎么构建的，计算是为了什么目的（不会又是什么胶体银吸附DNA做表面增强拉曼光谱吧）。

作者
Author: hphz 时间: 2025-7-2 19:19

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2025-7-2 18:27
比当前报错更加基本的问题在于，这1177个原子的体系基本做不动DFT级别下的几何优化振动分析，更何况只给Win ...

谢谢老师的指正，您说的很对，因为我们也有服务器，只是目前想在自己的电脑上试一下能不能正常运行。但是听您的回答之后，我想了一下确实很难做这么多原子，之后可能只用不到10mer去做这个几何优化。对于您的第二个回答，我是希望能够使银原子和目标的碱基形成配位键，也已经有人去做这个事情了。还是非常感谢您的回答！

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