计算化学公社
标题:
cp2k输出的优化后的xyz结构失去周期性,如何添加周期性信息?
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作者Author:
皮卡丘闪电链
时间:
2025-7-7 16:15
标题:
cp2k输出的优化后的xyz结构失去周期性,如何添加周期性信息?
各位老师好,我用cp2k优化了一个大体系结构,如图所示
然后用卢老师的Multiwfn软件对他做了cif格式转换,
结果显示Pd团簇位于边角位置。
这个问题群里请教了卢老师,的确可以通过Multiwfn软件位移Pd团簇至视角中心,但问题在于底部的TiO2结构也要随之改变,这个要跟随Pd团簇的移动而移动。
因此请教各位老师,这个问题如何解决。
附件为cp2k输出的restart文件,可以通过multiwfn软件进行转换。
作者Author:
jonson
时间:
2025-7-8 11:07
这个本质没啥区别的,就是视觉效果
作者Author:
qczcb2
时间:
2025-7-8 11:29
把restart导入multiwfn ,选择主功能300,7进入结构操作,然后24,enter,让所有体系居中,22,将所有原子卷回盒子内,最后输入-4输出cif即可。可见附件的log和cif
作者Author:
皮卡丘闪电链
时间:
2025-7-8 15:44
qczcb2 发表于 2025-7-8 11:29
把restart导入multiwfn ,选择主功能300,7进入结构操作,然后24,enter,让所有体系居中,22,将所有原子卷回 ...
感谢您的回复!真的感谢!
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