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标题: 如何构建缺陷石墨烯的力场参数？ [打印本页]

作者
Author: Chemlotus 时间: 2025-7-9 10:48
标题: 如何构建缺陷石墨烯的力场参数？
各位老师，我想请教下如何构建缺陷石墨烯的力场参数用于分子动力学模拟（五圆环、八圆环部分替代了六元环的缺陷石墨烯，目前已用DFT优化得到的缺陷石墨烯的结构及原子电荷），请各位老师不吝指教，谢谢！另外想问下参照社长开发的Sobtop程序中的例7构建缺陷石墨烯的力场参数是否合理？（例7：产生碳纳米管的GROMACS拓扑文件；http://sobereva.com/soft/Sobtop/#ex7）

作者
Author: sobereva 时间: 2025-7-9 11:17
用sobtop产生就可以。没较高要求的话就直接让sobtop猜合适的力常数，并以DFT优化的结构定义平衡键长/键角/二面角

作者
Author: Chemlotus 时间: 2025-7-9 12:23

sobereva 发表于 2025-7-9 11:17
用sobtop产生就可以。没较高要求的话就直接让sobtop猜合适的力常数，并以DFT优化的结构定义平衡键长/键角/ ...

好的，谢谢社长。

作者
Author: 1030266769 时间: 2025-7-10 15:02

sobereva 发表于 2025-7-9 11:17
用sobtop产生就可以。没较高要求的话就直接让sobtop猜合适的力常数，并以DFT优化的结构定义平衡键长/键角/ ...

站长 lammps的话可以用什么

作者
Author: sobereva 时间: 2025-7-10 22:39

1030266769 发表于 2025-7-10 15:02
站长 lammps的话可以用什么

不能。但可以把gromacs的拓扑文件转成lammps的，通过InterMol（https://github.com/shirtsgroup/InterMol）

作者
Author: 1030266769 时间: 2025-7-11 16:27

sobereva 发表于 2025-7-10 22:39
不能。但可以把gromacs的拓扑文件转成lammps的，通过InterMol（https://github.com/shirtsgroup/InterMol ...

谢谢站长

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