计算化学公社

标题: 硅酸镁蒸发过渡态的寻找问题 [打印本页]

作者
Author:
luohaiyang    时间: 2017-3-31 00:22
标题: 硅酸镁蒸发过渡态的寻找问题
老师让我找一下硅酸镁(MgSiO3或Mg2SiO4)熔体蒸发的过渡态,感觉有点无从下手,请各位指导一下。硅酸镁熔体结构是硅氧四面体的骨架连接起来,然后中间有镁离子。蒸发出来的物种是SiO, O, O2和Mg为主。之前有一个想法是把VaspMD模拟出的硅酸镁熔体结构提取到Gaussian中剪成一个cluster,然后分别去找分解生成SiO,O,O2,Mg的过渡态。

问题一:这样做合理吗?一是涉及到Vasp和Gaussian两个差别很大的软件,二是剪出来的结构总是存在些问题。不知道Gaussian能直接做出这样的熔体结构不?
问题二:如果可以试试做下,这种断键蒸发的过渡态怎么找?纯的MgSiO3熔体结构要去考虑溶剂效应吗?然后生成物相当于是熔体结构+气相分子,一个可能带很多电荷,一个为中性,为了找过渡态想一起结构优化该如何考虑呢?

问题有点奇葩,希望各位老师指点一二,万分感谢!
作者
Author:
sobereva    时间: 2017-3-31 23:55
有相关文献做类似体系的蒸发过渡态的研究没?无从下手的话先找相关文献,否则肯定最后白费很多功夫。

VASP直接也能找过渡态,何必非得再改用高斯,这会牵扯到团簇截取问题,弄不好会比较麻烦。
熔体没有溶剂效应一说,因为所有原子都是直接在你计算模型里表达出来的。溶剂效应是对于溶质+溶剂而言的。
作者
Author:
luohaiyang    时间: 2017-4-1 11:35
sobereva 发表于 2017-3-31 23:55
有相关文献做类似体系的蒸发过渡态的研究没?无从下手的话先找相关文献,否则肯定最后白费很多功夫。

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好的,谢谢sob老师!




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