计算化学公社

标题: 随便选的一批分子的T1诊断值 [打印本页]

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-31 08:48
标题: 随便选的一批分子的T1诊断值
T1诊断对于判断静态相关强弱很有用。随便选了一批五花八门的分子，用g09做了下T1诊断。绝大部分都是B3LYP/def2-TZVP优化的结构，然后在def2-TZVP基组下做的T1诊断。对于T1诊断值大的体系很多还考虑了冻核和不冻核的影响。表格里面带U的是对称破缺计算的结果，R则是限制性闭壳层的结果。若未注明，算的都是体系的基态。对很多体系也测试了在def2-SVP下做诊断，数值和def2-TZVP差别很小，仅对含过渡金属差别略大但也定性一致。

(, 下载次数 Times of downloads: 550)

可见对于含过渡金属的体系冻不冻核往往影响挺大。如预期的，大部分过渡金属确实体现出了比普通有机体系更大的诊断值，但也并非配合物的诊断值一定大，如[Re2Cl8]2-、顺铂。也对比了个别有机反应的反应物、产物、TS的诊断值（HCN异构化、丁二烯闭环），有点TS下的数值明显更大，如前者，但并非都是如此，如后者。对于双自由基体系，如C4H8，可见UHF参考态明显比RHF更好，诊断值小得多。总之，结果基本都和一般理论直觉一致，不过CN自由基数值那么大有点意外。

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2017-3-31 09:29
恭喜大博士加入测试大军，话说T1诊断是用来定量计算静态相关强弱的吧？如果用Grimme的NFOD值该怎么操作呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2017-3-31 09:54

我本是个娃娃发表于 2017-3-31 09:29
恭喜大博士加入测试大军，话说T1诊断是用来定量计算静态相关强弱的吧？如果用Grimme的NFOD值该怎么操作呢？

是
RTFM

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2017-3-31 09:58

sobereva 发表于 2017-3-31 09:54
是
RTFM

作者
Author: moulihui 时间: 2019-8-8 10:24
请问不冻核的关键词是什么？

作者
Author: sobereva 时间: 2019-8-9 03:59

moulihui 发表于 2019-8-8 10:24
请问不冻核的关键词是什么？

Gaussian里是Full，比如CCSD(T,full)，代表做不冻核的CCSD(T)

作者
Author: beefly 时间: 2019-8-9 05:59

sobereva 发表于 2019-8-9 03:59
Gaussian里是Full，比如CCSD(T,full)，代表做不冻核的CCSD(T)

full一定要写在括号里边，有学生曾经用mp2算一个不大不小的体系，误把mp2(full)写成mp2 full，结果撞到一个gaussian的彩蛋，程序把bd(t)及其各种向下兼容的post-HF都算了一遍。原指望两三天出结果，结果半个月都没算完。

作者
Author: moulihui 时间: 2019-8-9 11:01

sobereva 发表于 2019-8-9 03:59
Gaussian里是Full，比如CCSD(T,full)，代表做不冻核的CCSD(T)

谢谢sob老师！

作者
Author: moulihui 时间: 2019-8-9 11:04

beefly 发表于 2019-8-9 05:59
full一定要写在括号里边，有学生曾经用mp2算一个不大不小的体系，误把mp2(full)写成mp2 full，结果撞到一 ...

多谢提醒！

作者
Author: Somnus荣小荣 时间: 2020-4-10 10:53
老师，请问一下计算T1诊断，最标准的计算是在什么水平下进行的呢，若使用不同的方法一般的误差能有多大（体系仅包含8个原子，碳氢氧硫）

作者
Author: sobereva 时间: 2020-4-11 23:14

Somnus荣小荣发表于 2020-4-10 10:53
老师，请问一下计算T1诊断，最标准的计算是在什么水平下进行的呢，若使用不同的方法一般的误差能有多大（体 ...

不需要大基组，CCSD/cc-pVDZ都足以得到定性正确的结果

作者
Author: 嘤嘤嘤 时间: 2021-7-14 20:48
请问T1诊断值是不是需要在原来的方法基组上进行计算？计算小白表示T1诊断值是什么物理意义都不知道。看了Sob老师说的还是完全不懂，感觉比结构化学还难懂QAQ

作者
Author: sobereva 时间: 2021-7-14 22:49

嘤嘤嘤发表于 2021-7-14 20:48
请问T1诊断值是不是需要在原来的方法基组上进行计算？计算小白表示T1诊断值是什么物理意义都不知道。看了So ...

结构化学跟计算量子化学根本没有可比性

我不知道你说的“原来”指的是什么。反正对基组没有特定的要求

参考北京科音中级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/KBQC）的幻灯片：

(, 下载次数 Times of downloads: 48)

(, 下载次数 Times of downloads: 56)

没有点基本的量子化学、电子结构方面的知识不可能充分理解。

作者
Author: 嘤嘤嘤 时间: 2021-7-15 10:36

sobereva 发表于 2021-7-14 22:49
结构化学跟计算量子化学根本没有可比性

我不知道你说的“原来”指的是什么。反正对基组没有特定的要求 ...

原来指的是我用DFT方法的结构优化和CCSDT的单电能计算。我这两个都需要T1诊断值吗？还是说只有CCSDT需要？在T1计算的时候，方法是CCSD加关键词T1diage是吗？基组随便？

作者
Author: biogon 时间: 2021-7-15 10:44

嘤嘤嘤发表于 2021-7-15 10:36
原来指的是我用DFT方法的结构优化和CCSDT的单电能计算。我这两个都需要T1诊断值吗？还是说只有CCSDT需要 ...

你先搞清楚到底是CCSDT还是CCSD(T)，怎么做T1诊断自个看用的程序的手册

作者
Author: 嘤嘤嘤 时间: 2021-7-15 16:01

biogon 发表于 2021-7-15 10:44
你先搞清楚到底是CCSDT还是CCSD(T)，怎么做T1诊断自个看用的程序的手册

CCSD（T），好的吧我看了Gaussian的手册搜索T1出现了两个1 Computes the Q1 diagnostic of T. J. Lee and coworkers [195, 654]. Note that Q1 is analogous to the T1
diagnostic for CCSD when it is computed using QCISD instead of the Coupled Cluster method.
2 Computes the T1 diagnostic of T. J. Lee and coworkers [195] (CCSD only).
所以我看一下标注的参考文献就能懂了嘛？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2021-7-15 17:15

嘤嘤嘤发表于 2021-7-15 09:01
CCSD（T），好的吧我看了Gaussian的手册搜索T1出现了两个1 Computes the Q1 diagnostic of T. J. Lee and ...

对，看参考文献[195]，如果有不懂的，找一些量化教材，对着教材的coupled cluster的章节看

作者
Author: 嘤嘤嘤 时间: 2021-7-15 20:39

wzkchem5 发表于 2021-7-15 17:15
对，看参考文献[195]，如果有不懂的，找一些量化教材，对着教材的coupled cluster的章节看

好的谢谢老师

作者
Author: SS123 时间: 2022-1-10 17:52

sobereva 发表于 2019-8-9 03:59
Gaussian里是Full，比如CCSD(T,full)，代表做不冻核的CCSD(T)

请问sob老师，对过渡金属团簇而言，在高斯里做冻核和不冻核的CCSD(T)，两者算出的能量是不是也差别很大？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-1-11 03:44

SS123 发表于 2022-1-10 17:52
请问sob老师，对过渡金属团簇而言，在高斯里做冻核和不冻核的CCSD(T)，两者算出的能量是不是也差别很大？

是

作者
Author: 糖糖糖豆9988 时间: 2022-11-7 09:14
本帖最后由糖糖糖豆9988 于 2022-11-7 09:37 编辑

Sob老师您好，请问对于双自由基计算T1诊断值的时候，直接写上关键词，再输入 “读取人为构造对称破缺初猜波函数前提下，优化得到的分子坐标” 就可以吗？计算T1诊断值不需要在重新构造对称破缺态了吧？

作者
Author: sobereva 时间: 2022-11-7 10:14

糖糖糖豆9988 发表于 2022-11-7 09:14
Sob老师您好，请问对于双自由基计算T1诊断值的时候，直接写上关键词，再输入 “读取人为构造对称破缺初猜波 ...

是

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)