计算化学公社
标题:
体系势能为正有没有什么解决办法?
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作者Author:
appleliu
时间:
2025-7-13 16:55
标题:
体系势能为正有没有什么解决办法?
请问有没有人解决过系统弛豫稳定后总体势能为正的问题呀,我最近遇到了这个问题,但不知道解决办法,各位大神求指点!!!按理说总体势能为负值呀,我用的OPLS-AA力场。新手求求求教!!!
作者Author:
sobereva
时间:
2025-7-14 02:57
发帖时候别打那么多叹号,显得极其浮躁,令人反感。本论坛是正经、专业的讨论场所,注意描述问题时的语气
先具体交代清楚体系是什么样,认真看
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620
(
http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
)
没具体前提只能问算命的
为正本来就未必有什么必然性的错误,诸如算的是环张力特别大的分子,按照力场势函数的定义,显然势能会明显为正
作者Author:
appleliu
时间:
2025-7-14 09:56
本帖最后由 appleliu 于 2025-7-14 10:03 编辑
谢谢老师提醒。我的计算体系是用OPLS-AA力场模拟直链C6F14液相分子在铜基底表面的蒸发行为,采用的是参考文献
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.langmuir.7b01410
中描述的详细力场参数,我计算出来的密度可以和NIST数据库对应到,对应附件中的图1,就是我看许多类似长链分子的蒸发体系,计算得到的液相势能都是负值,而且我理解的是势能为负才表示系统稳定,所以我有点不确定我的体系是否正确。进一步我模拟了纯液相C6F14体系的弛豫过程,并计算了非键相互作用、成键相互作用,得到
evdwl
为几百的正值
ecoul
为正值
ebond eangle
也为正值,
edihed
为负值,具体数据如附件图2,示例代码如附件图3,代码按照文献中数据完全还原。请大家有空帮我看看我的计算是否合理,感谢大家百忙之中抽空查看,谢谢。
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